Java生物信息- 判斷鹼基有沒有連續的重複序列

連續的四個鹼基的重複


不能判斷是否有多個鹼基的重複

public class TestConsecutiveBases{

  public static void main (String[] args) {
    java.util.Scanner input = new java.util.Scanner(System.in);
    
    System.out.print("Enter the number of values: ");
    String DNASeq = input.nextLine();
    
    if (isConsecutiveFour(DNASeq))
      System.out.println("The series has consecutive four bases");
    else
    	System.out.println("The series has no consecutive four bases");
  }

  public static boolean isConsecutiveFour(String T) { 
	char[] DT = T.toCharArray();   
    for (int i = 0; i < DT.length - 3; i++) {
      boolean isEqual = true;        
      for (int j = i; j < i + 3; j++) {
        if (DT[j] != (DT[j + 1])) {
          isEqual = false;
          break;
        }
      }
     
      if (isEqual) return true;
    }
    
    return false;
  }
}


發表評論
所有評論
還沒有人評論,想成為第一個評論的人麼? 請在上方評論欄輸入並且點擊發布.
相關文章