BindingDB是一個公開的，可通過網絡訪問的測量結合親和力的數據庫，主要關注被認爲是藥物靶標的蛋白質與類似藥物的小分子之間的相互作用。 BindingDB包含1,735,582個結合數據，涉及7,352個蛋白質靶標和770,124個小分子。
There are 2291 protein-ligand crystal structures with BindingDB affinity measurements for proteins with 100% sequence identity, and 5816 crystal structures allowing proteins to 85% sequence identity.