SuperTarget數據庫詳解

原創 褚骏逸 2020-06-19 05:18

SuperTarget：http://insilico.charite.de/supertarget/index.php

SuperTarget是一個收集有關藥物-靶點關係的信息的數據庫。 SuperTarget整合了DrugBank, BindingDB and SuperCyp。

它主要由三種不同類型的實體組成：

  • 藥物：BindingDB映射並整合到SuperTarget，並分配元數據作爲ATC-codes (Anatomical Therapeutic Chemical)、結構信息和結合親和力。
  • 蛋白質：從UniProt中提取，同時提供Targets間相互作用，序列相似性，PDB三維結構，EC編號。
  • 副作用：從SIDER中提取的。

除此之外，還可以獲得關於pathways和ontologie的信息。有單獨的章節專門介紹了一組特殊的靶點——細胞色素p450。

 

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