我們知道，建站人員必須爲建立的每個Internet站點都指定一個主目錄。主目錄是一個缺省位置，當Internet用戶的請求沒有指定特定文件時，IIS將把用戶的請求指向這個缺省位置。代表站點的主目錄一旦建立，IIS就會缺省地使這一目錄結構全部都能由網絡遠程用戶所訪問，也就是說，該站點的根目錄(即主目錄)及其所有子目錄都包含在站點結構(即主目錄結構)中，並全部能由網絡上的用戶所訪問。一般說來，Internet站點的內容都應當維持在一個單獨的目錄結構內，以免引起訪問請求混亂的問題。特殊情況下，網絡管理人員可能因爲某種需要而使用除實際站點目錄(即主目錄)以外的其他目錄，或者使用其他計算機上的目錄，來讓Internet用戶作爲站點訪問。這時，就可以使用虛擬目錄，即將想使用的目錄設爲虛擬目錄，而讓用戶訪問。
處理虛擬目錄時，IIS把它作爲主目錄的一個子目錄來對待；而對於Internet上的用戶來說，訪問時並感覺不到虛擬目錄與站點中其他任何目錄之間有什麼區別，可以像訪問其他目錄一樣來訪問這一虛擬目錄。設置虛擬目錄時必須指定它的位置，虛擬目錄可以存在於本地服務器上，也可以存在於遠程服務器上。多數情況下虛擬目錄都存在於遠程服務器上，此時，用戶訪問這一虛擬目錄時，IIS服務器將充當一個代理的角色，它將通過與遠程計算機聯繫並檢索用戶所請求的文件來實現信息服務支持。
創建虛擬目錄的操作步驟如下：1)，並從中展開IIS項，MMC將顯示IIS的配置選項。
(2) 使用鼠標右鍵單擊想要配置其虛擬目錄的站點，這會打開一個快捷菜單，從中單擊“新增”子菜單下的“虛擬目錄”命令，MMC即會啓動“新虛擬目錄嚮導”並顯示其對話框。
(3) 在該對話框中的“用來訪問虛擬目錄的別名”字段框中爲欲建的虛擬目錄定義一個名字，如“newspaper”，然後單擊“下一步”按鈕繼續。
(4) 在隨後出現的對話框中，需要輸入該虛擬目錄的物理位置，即其實際位置。如果該虛擬目錄在本地服務器中，則可直接指定路徑，如“C:\mywebsite\myvirtualdirectory”；如果它在遠程的服務器中，則需指定服務器名和虛擬目錄的共享名(此時虛擬目錄必須具有網絡共享的屬性)，如“\\servemame\sharename”。然後單擊“下一步”按鈕，新虛擬目錄嚮導將顯示設置訪問權限的對話框。
(5) 從中爲虛擬目錄所代表的站點選擇適當的權限。最後，單擊“完成”按鈕，所設虛擬目錄即可生效。
以後，輸入站點的URL地址並在後面依次加上斜槓(/)和虛擬目錄的別名，即可訪問該虛擬目錄。例如，原站點的URL地址爲www.mywebsite.com，建立名爲newspaper的虛擬目錄後，輸入www.mywebsite.com/newspaper即可訪問這個虛擬目錄。使用虛擬目錄的重要意義是，網絡管理員可以把Web站點的負載分佈到多臺服務器上，這樣使每臺服務器都能保持較高的處理速度。
設置主頁文件
在用戶訪問Web服務器的時候，如果要求他們必須記住並輸入該站點的主頁文件，這顯然是不現實的。所以我們需要爲服務器設置一個默認的主頁文件，從而用戶只需輸入Web服務器站點的地址，便可以直接瀏覽該站點的主頁，繼而通過主頁中的超鏈接去訪問站點中的其他網頁內容。在IIS的Web服務器中，一個站點的主頁文件是可以任意設置的。具體操作方法如下：
(1) 在MMC中選取想要配置的Web站點並單擊鼠標右鍵，然後從出現的快捷菜單中選擇“屬性”命令，即可打開當前所選站點的屬性對話框，從中單擊並打開“文檔”選項卡。
(2) 選中“啓用默認文檔”複選項，然後單擊“添加”按鈕，從出現的“添加默認文檔”對話框中輸入主頁文件名並單擊“確定”按鈕，即可把主頁文件添加到“文檔”選項卡中。
) 如果選項卡中的列表框內有多個主頁文件，用戶可單擊左邊的上、下箭頭按鈕，來調整它們的先後順序，排在最上面的將是默認的主頁文件，瀏覽器默認打開的就是該文件。
(4) 對於不需要的主頁文件，用戶還可以選中它後單擊旁邊的“刪除”按鈕，把它從列表中刪除掉。
(5)NT-FAMILY: 宋體; mso-ascii-font-family: 'Times New Roman'; mso-hansi-font-family: 'Times New Roman'">另外，如有需要，還可以在選項卡中指定是否需要“啓用文檔腳註”，以及指定腳註文件等。
(6) 最後單擊“確定”按鈕，即可使設置的主頁文件生效
