以安裝Github上的Achilles包爲例進行安裝說明。
描述
1.安裝包路徑:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started
2.該包功能:進行臨牀表徵分析
R語言包安裝過程總結:
第一步:環境準備
前提條件
1.安裝jdk環境變量
2.配置R語言環境變量
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java環境變量配置
參考資料網站:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/94580789
第二步:安裝R語言包
【注意】進行第二步的前提條件是第一步的環境準備都已經完成了。
方法一:網絡在線安裝github包
(1)加載安裝包
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
library(rJava)###java環境變量配置
devtools::install_github("OHDSI/Achilles")
如果下面的library命令能加載執行,則說明包安裝成功。
library(Achilles)
library(DatabaseConnector)
方法二:從github上下載zip包後離線手動安裝
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)
devtools::install_local("C://Users//TD//Desktop//Achilles-master.zip") #鏡像選擇all-- 1
離線包安裝參考資料爲:https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/88768770
zip包下載路徑:https://github.com/OHDSI/Achilles#getting-started
方法三:將其它電腦環境中安裝好的library,包含這個包的library進行壓縮zip,再將壓縮好的zip進行相應的替換(替換時需要關閉R和Rstudio),就可使用。替換前還是要先執行下面的命令。
install.packages("devtools")
install.packages("rJava")
library(rJava)
library(devtools)
library(usethis)