註冊表分成兩大部分，包含着多個組成文件。
一、系統配置文件
Windows 2003/2000/XP 註冊表中的系統配置文件存放在系統“Windows\system32\config”目錄下，這些文件分別是default、sam、security、software、system及userdiff，我們一般稱這些文件爲“配置單元”
二、用戶配置文件
Windows 2003/2000/XP 註冊表中的用戶配置文件存放在系統“Documents And Settings”目錄下，不同的用戶有着不同的配置文件，這也是基於多用戶操作系統的不同之處。一般在所有的用戶配置文件目錄下都有着兩個基本文件“Ntuser.dat”及“Ntuser.i n i ”，這兩個文件是具有隱藏和系統屬性功=能的系統文件，其中包含了用戶最基本的配置情況。