Python 數據分析包:pandas 基礎

pandas 是基於 Numpy 構建的含有更高級數據結構和工具的數據分析包

類似於 Numpy 的核心是 ndarray,pandas 也是圍繞着 Series 和 DataFrame 兩個核心數據結構展開的 。Series 和 DataFrame 分別對應於一維的序列和二維的表結構。pandas 約定俗成的導入方法如下:

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from pandas import Series,DataFrame
import pandas as pd

 

Series


Series 可以看做一個定長的有序字典。基本任意的一維數據都可以用來構造 Series 對象:

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>>> s = Series([1,2,3.0,'abc'])
>>> s
0      1
1      2
2      3
3    abc
dtype: object

雖然 dtype:object 可以包含多種基本數據類型,但總感覺會影響性能的樣子,最好還是保持單純的 dtype。

Series 對象包含兩個主要的屬性:index 和 values,分別爲上例中左右兩列。因爲傳給構造器的是一個列表,所以 index 的值是從 0 起遞增的整數,如果傳入的是一個類字典的鍵值對結構,就會生成 index-value 對應的 Series;或者在初始化的時候以關鍵字參數顯式指定一個 index 對象:

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>>> s = Series(data=[1,3,5,7],index = ['a','b','x','y'])
>>> s
a    1
b    3
x    5
y    7
dtype: int64
>>> s.index
Index(['a''b''x''y'], dtype='object')
>>> s.values
array([1357], dtype=int64)

Series 對象的元素會嚴格依照給出的 index 構建,這意味着:如果 data 參數是有鍵值對的,那麼只有 index 中含有的鍵會被使用;以及如果 data 中缺少響應的鍵,即使給出 NaN 值,這個鍵也會被添加。

注意 Series 的 index 和 values 的元素之間雖然存在對應關係,但這與字典的映射不同。index 和 values 實際仍爲互相獨立的 ndarray 數組,因此 Series 對象的性能完全 ok。

Series 這種使用鍵值對的數據結構最大的好處在於,Series 間進行算術運算時,index 會自動對齊。

另外,Series 對象和它的 index 都含有一個 name 屬性:

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>>> s.name = 'a_series'
>>> s.index.name = 'the_index'
>>> s
the_index
a            1
b            3
x            5
y            7
Name: a_series, dtype: int64

 

DataFrame


DataFrame 是一個表格型的數據結構,它含有一組有序的列(類似於 index),每列可以是不同的值類型(不像 ndarray 只能有一個 dtype)。基本上可以把 DataFrame 看成是共享同一個 index 的 Series 的集合。

DataFrame 的構造方法與 Series 類似,只不過可以同時接受多條一維數據源,每一條都會成爲單獨的一列:

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>>> data = {'state':['Ohino','Ohino','Ohino','Nevada','Nevada'],
        'year':[2000,2001,2002,2001,2002],
        'pop':[1.5,1.7,3.6,2.4,2.9]}
>>> df = DataFrame(data)
>>> df
   pop   state  year
0  1.5   Ohino  2000
1  1.7   Ohino  2001
2  3.6   Ohino  2002
3  2.4  Nevada  2001
4  2.9  Nevada  2002
 
[5 rows x 3 columns]

雖然參數 data 看起來是個字典,但字典的鍵並非充當 DataFrame 的 index 的角色,而是 Series 的 “name” 屬性。這裏生成的 index 仍是 “01234”。

完整的 DataFrame 構造器參數爲:DataFrame(data=None,index=None,coloumns=None),columns 即 “name”:

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>>> df = DataFrame(data,index=['one','two','three','four','five'],
               columns=['year','state','pop','debt'])
>>> df
       year   state  pop debt
one    2000   Ohino  1.5  NaN
two    2001   Ohino  1.7  NaN
three  2002   Ohino  3.6  NaN
four   2001  Nevada  2.4  NaN
five   2002  Nevada  2.9  NaN
 
[5 rows x 4 columns]

同樣缺失值由 NaN 補上。看一下 index、columns 和 索引的類型:

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>>> df.index
Index(['one''two''three''four''five'], dtype='object')
>>> df.columns
Index(['year''state''pop''debt'], dtype='object')
>>> type(df['debt'])
<class 'pandas.core.series.Series'>

DataFrame 面向行和麪向列的操作基本是平衡的,任意抽出一列都是 Series。

對象屬性


重新索引

Series 對象的重新索引通過其 .reindex(index=None,**kwargs) 方法實現。**kwargs 中常用的參數有倆:method=None,fill_value=np.NaN

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ser = Series([4.5,7.2,-5.3,3.6],index=['d','b','a','c'])
>>> a = ['a','b','c','d','e']
>>> ser.reindex(a)
a   -5.3
b    7.2
c    3.6
d    4.5
e    NaN
dtype: float64
>>> ser.reindex(a,fill_value=0)
a   -5.3
b    7.2
c    3.6
d    4.5
e    0.0
dtype: float64
>>> ser.reindex(a,method='ffill')
a   -5.3
b    7.2
c    3.6
d    4.5
e    4.5
dtype: float64
>>> ser.reindex(a,fill_value=0,method='ffill')
a   -5.3
b    7.2
c    3.6
d    4.5
e    4.5
dtype: float64

.reindex() 方法會返回一個新對象,其 index 嚴格遵循給出的參數,method:{'backfill', 'bfill', 'pad', 'ffill', None} 參數用於指定插值(填充)方式,當沒有給出時,自動用fill_value 填充,默認爲 NaN(ffill = pad,bfill = back fill,分別指插值時向前還是向後取值)

DataFrame 對象的重新索引方法爲:.reindex(index=None,columns=None,**kwargs)。僅比 Series 多了一個可選的 columns 參數,用於給列索引。用法與上例類似,只不過插值方法 method 參數只能應用於,即軸 0。

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>>> state = ['Texas','Utha','California']
>>> df.reindex(columns=state,method='ffill')
    Texas  Utha  California
a      1   NaN           2
c      4   NaN           5 
d      7   NaN           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> df.reindex(index=['a','b','c','d'],columns=state,method='ffill')
   Texas  Utha  California
a      1   NaN           2
b      1   NaN           2
c      4   NaN           5
d      7   NaN           8
 
[4 rows x 3 columns]

不過 fill_value 依然對有效。聰明的小夥伴可能已經想到了,可不可以通過 df.T.reindex(index,method='**').T 這樣的方式來實現在列上的插值呢,答案是可行的。另外要注意,使用 reindex(index,method='**') 的時候,index 必須是單調的,否則就會引發一個 ValueError: Must be monotonic for forward fill,比如上例中的最後一次調用,如果使用 index=['a','b','d','c'] 的話就不行。

刪除指定軸上的項

即刪除 Series 的元素或 DataFrame 的某一行(列)的意思,通過對象的 .drop(labels, axis=0) 方法:

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>>> ser
d    4.5
b    7.2
a   -5.3
c    3.6
dtype: float64
>>> df
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> ser.drop('c')
d    4.5
b    7.2
a   -5.3
dtype: float64
>>> df.drop('a')
   Ohio  Texas  California
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[2 rows x 3 columns]
>>> df.drop(['Ohio','Texas'],axis=1)
   California
a           2
c           5
d           8
 
[3 rows x 1 columns]

.drop() 返回的是一個新對象,元對象不會被改變。

索引和切片

就像 Numpy,pandas 也支持通過 obj[::] 的方式進行索引和切片,以及通過布爾型數組進行過濾。

不過須要注意,因爲 pandas 對象的 index 不限於整數,所以當使用非整數作爲切片索引時,它是末端包含的。

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>>> foo
a    4.5
b    7.2
c   -5.3
d    3.6
dtype: float64
>>> bar
0    4.5
1    7.2
2   -5.3
3    3.6
dtype: float64
>>> foo[:2]
a    4.5
b    7.2
dtype: float64
>>> bar[:2]
0    4.5
1    7.2
dtype: float64
>>> foo[:'c']
a    4.5
b    7.2
c   -5.3
dtype: float64

這裏 foo 和 bar 只有 index 不同——bar 的 index 是整數序列。可見當使用整數索引切片時,結果與 Python 列表或 Numpy 的默認狀況相同;換成 'c' 這樣的字符串索引時,結果就包含了這個邊界元素。

另外一個特別之處在於 DataFrame 對象的索引方式,因爲他有兩個軸向(雙重索引)。

可以這麼理解:DataFrame 對象的標準切片語法爲:.ix[::,::]。ix 對象可以接受兩套切片,分別爲行(axis=0)和列(axis=1)的方向:

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>>> df
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> df.ix[:2,:2]
   Ohio  Texas
a     0      1
c     3      4
 
[2 rows x 2 columns]
>>> df.ix['a','Ohio']
0

而不使用 ix ,直接切的情況就特殊了:

  • 索引時,選取的是列
  • 切片時,選取的是行

這看起來有點不合邏輯,但作者解釋說 “這種語法設定來源於實踐”,我們信他。

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>>> df['Ohio']
a    0
c    3
d    6
Name: Ohio, dtype: int32
>>> df[:'c']
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
 
[2 rows x 3 columns]
>>> df[:2]
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
 
[2 rows x 3 columns]

使用布爾型數組的情況,注意行與列的不同切法(列切法的 : 不能省):

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>>> df['Texas']>=4
a    False
c     True
d     True
Name: Texas, dtype: bool
>>> df[df['Texas']>=4]
   Ohio  Texas  California
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[2 rows x 3 columns]
>>> df.ix[:,df.ix['c']>=4]
   Texas  California
a      1           2
c      4           5
d      7           8
 
[3 rows x 2 columns]

 


算術運算和數據對齊

pandas 最重要的一個功能是,它可以對不同索引的對象進行算術運算。在將對象相加時,結果的索引取索引對的並集。自動的數據對齊在不重疊的索引處引入空值,默認爲 NaN。

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>>> foo = Series({'a':1,'b':2})
>>> foo
a    1
b    2
dtype: int64
>>> bar = Series({'b':3,'d':4})
>>> bar
b    3
d    4
dtype: int64
>>> foo + bar
a   NaN
b     5
d   NaN
dtype: float64

DataFrame 的對齊操作會同時發生在行和列上。

當不希望在運算結果中出現 NA 值時,可以使用前面 reindex 中提到過 fill_value 參數,不過爲了傳遞這個參數,就需要使用對象的方法,而不是操作符:df1.add(df2,fill_value=0)。其他算術方法還有:sub(), div(), mul()

Series 和 DataFrame 之間的算術運算涉及廣播,暫時先不講。

函數應用和映射

Numpy 的 ufuncs(元素級數組方法)也可用於操作 pandas 對象。

當希望將函數應用到 DataFrame 對象的某一行或列時,可以使用 .apply(func, axis=0, args=(), **kwds) 方法。

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= lambda x:x.max()-x.min()
>>> df
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> df.apply(f)
Ohio          6
Texas         6
California    6
dtype: int64
>>> df.apply(f,axis=1)
a    2
c    2
d    2
dtype: int64

 

排序和排名

Series 的 sort_index(ascending=True) 方法可以對 index 進行排序操作,ascending 參數用於控制升序或降序,默認爲升序。

若要按值對 Series 進行排序,當使用 .order() 方法,任何缺失值默認都會被放到 Series 的末尾。

在 DataFrame 上,.sort_index(axis=0, by=None, ascending=True) 方法多了一個軸向的選擇參數與一個 by 參數,by 參數的作用是針對某一(些)進行排序(不能對行使用 by 參數):

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>>> df.sort_index(by='Ohio')
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> df.sort_index(by=['California','Texas'])
   Ohio  Texas  California
a     0      1           2
c     3      4           5
d     6      7           8
 
[3 rows x 3 columns]
>>> df.sort_index(axis=1)
   California  Ohio  Texas
a           2     0      1
c           5     3      4
d           8     6      7
 
[3 rows x 3 columns]

排名(Series.rank(method='average', ascending=True))的作用與排序的不同之處在於,他會把對象的 values 替換成名次(從 1 到 n)。這時唯一的問題在於如何處理平級項,方法裏的 method 參數就是起這個作用的,他有四個值可選:average, min, max, first

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>>> ser=Series([3,2,0,3],index=list('abcd'))
>>> ser
a    3
b    2
c    0
d    3
dtype: int64
>>> ser.rank()
a    3.5
b    2.0
c    1.0
d    3.5
dtype: float64
>>> ser.rank(method='min')
a    3
b    2
c    1
d    3
dtype: float64
>>> ser.rank(method='max')
a    4
b    2
c    1
d    4
dtype: float64
>>> ser.rank(method='first')
a    3
b    2
c    1
d    4
dtype: float64

注意在 ser[0]=ser[3] 這對平級項上,不同 method 參數表現出的不同名次。

DataFrame 的 .rank(axis=0, method='average', ascending=True) 方法多了個 axis 參數,可選擇按行或列分別進行排名,暫時好像沒有針對全部元素的排名方法。

統計方法

pandas 對象有一些統計方法。它們大部分都屬於約簡和彙總統計,用於從 Series 中提取單個值,或從 DataFrame 的行或列中提取一個 Series。

比如 DataFrame.mean(axis=0,skipna=True) 方法,當數據集中存在 NA 值時,這些值會被簡單跳過,除非整個切片(行或列)全是 NA,如果不想這樣,則可以通過 skipna=False 來禁用此功能:

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>>> df
    one  two
a  1.40  NaN
b  7.10 -4.5
c   NaN  NaN
d  0.75 -1.3
 
[4 rows x 2 columns]
>>> df.mean()
one    3.083333
two   -2.900000
dtype: float64
>>> df.mean(axis=1)
a    1.400
b    1.300
c      NaN
d   -0.275
dtype: float64
>>> df.mean(axis=1,skipna=False)
a      NaN
b    1.300
c      NaN
d   -0.275
dtype: float64

其他常用的統計方法有:

######################## ******************************************
count 非 NA 值的數量
describe 針對 Series 或 DF 的列計算彙總統計
min , max 最小值和最大值
argmin , argmax 最小值和最大值的索引位置(整數)
idxmin , idxmax 最小值和最大值的索引值
quantile 樣本分位數(0 到 1)
sum 求和
mean 均值
median 中位數
mad 根據均值計算平均絕對離差
var 方差
std 標準差
skew 樣本值的偏度(三階矩)
kurt 樣本值的峯度(四階矩)
cumsum 樣本值的累計和
cummin , cummax 樣本值的累計最大值和累計最小值
cumprod 樣本值的累計積
diff 計算一階差分(對時間序列很有用)
pct_change 計算百分數變化

 

處理缺失數據


pandas 中 NA 的主要表現爲 np.nan,另外 Python 內建的 None 也會被當做 NA 處理。

處理 NA 的方法有四種:dropna , fillna , isnull , notnull 。

is(not)null

這一對方法對對象做元素級應用,然後返回一個布爾型數組,一般可用於布爾型索引。

dropna

對於一個 Series,dropna 返回一個僅含非空數據和索引值的 Series。

問題在於對 DataFrame 的處理方式,因爲一旦 drop 的話,至少要丟掉一行(列)。這裏的解決方式與前面類似,還是通過一個額外的參數:dropna(axis=0, how='any', thresh=None) ,how 參數可選的值爲 any 或者 all。all 僅在切片元素全爲 NA 時才拋棄該行(列)。另外一個有趣的參數是 thresh,該參數的類型爲整數,它的作用是,比如 thresh=3,會在一行中至少有 3 個非 NA 值時將其保留。

fillna

fillna(value=None, method=None, axis=0) 中的 value 參數除了基本類型外,還可以使用字典,這樣可以實現對不同的列填充不同的值。method 的用法與前面 .reindex() 方法相同,這裏不再贅述。

inplace 參數


前面有個點一直沒講,結果整篇示例寫下來發現還挺重要的。就是 Series 和 DataFrame 對象的方法中,凡是會對數組作出修改並返回一個新數組的,往往都有一個 replace=False 的可選參數。如果手動設定爲 True,那麼原數組就可以被替換。

轉載:Python 數據分析包:pandas 基礎

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