Adsorption Locator是一款採用蒙特卡羅模擬退火方法搜索吸附質在基底材料.上的最低能量吸附構象的程序,它可以給出吸附質的穩定吸附位點、混合吸附質的優先吸附成分、納米級催化劑的活性位、原子層沉積過程的最穩定位置,幫助研究人員從原子水平上了解吸附過程(結構影響、添加劑作用)。在塗料開發、表面腐蝕研究、催化劑設計以及晶體結晶形貌等領域具有理論指導意義。其中,吸附質通常爲氣體分子或液體,基底可以是多孔晶體、無定形材料或表面結構材料。
Adsorption Locator的主要特性
●周 期性或者非週期性基底材料
●正則系綜(NVT)模擬
●可指定吸附區域
●支持Universal、COMPASS、Dreiding、peff、evff力場,支持自定義力場
●支持perl腳本編程處理
氧化鎂與二氧化硫建模優化過程
首先在晶體庫中導入MgO模型,利用Build Surface 功能切割出MgO的1 0 0晶面
擴建超胞後得到如下構型
建立15 Ǻ的真空度,以避免週期性對結構的影響。
Adsportion Location設置參數如下
確定selected target atoms 後設定的maximum distance所定義的區域將會使吸附質分子被引入的區域。5.0的距離允許體系確定不同構型的SO2吸附質在MgO表面的吸附。如果maximum adsorption distance 太小,某些SO2構型將得不到,如果太大構型數目將會增加。
結果分析:
產生了3種最可能的吸附構型,打開MgO(1 0 0)Fields.xsd。
這個文件顯示了吸附位的區域,更高的密度點表明了更可能的吸附位。
右擊此文件選擇Display Style 按鈕,打開Display Style對話框。在Field欄中點擊Color by field values,選擇Volume display style,關閉對話框。
現在最可能的吸附範圍以綠色顯示,最不可能的吸附位以紅色顯示。
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