Hbase meta 表異常修復

標籤（空格分隔）： Hbase

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2|0一，Hbase meta元數據表

 

2|11.1 背景

 

線上Hbase 因爲在hbase shell中清空 truncate 'table'一張表時候發現中途清空錯了，嗯下了Ctrl+c,導致某張表在RIT 階段。

2|21.2 meta表修復一

 

查看hbase:meta情況 hbase hbck

1.重新修復hbase meta表（根據hdfs上的.regioninfo文件，生成meta表）

hbase hbck -fixMeta

2.重新將hbase meta表分給regionserver（根據meta表，將meta表上的region分給regionservere）

hbase hbck -fixAssignments

2|31.3 meta表修復二

 

當出現漏洞 hbase hbck -fixHdfsHoles （新建一個region文件夾）

hbase hbck -fixMeta （根據regioninfo生成meta表）

hbase hbck -fixAssignments （分配region到regionserver上）</span>

2|41.4 meta表修復二

 

HDFS 層面缺少.regioninfo

hbase hbck -fixHdfsOrphans

2|51.5 hbase region 分配問題

 

region分配不到regionserver，zkCLi 進入zookeeper,刪除

rmr /hbase/region-in-transition

2|61.6 hbase region 引用文件出錯

 

Found lingering reference file hdfs：

hbase hbck -fixReferenceFiles

2|71.7 重複region問題

 

查看meta中的region scan 'hbase:meta' , {LIMIT=>10,FILTER=>"PrefixFilter('XXX')"}

在數據遷移的時候碰到兩個重複的region b0c8f08ffd7a96219f748ef14d7ad4f8，73ab00eaa7bab7bc83f440549b9749a3 刪除兩個重複的region

delete 'hbase:meta','INDEX_11,4380_2431,1429757926776.b0c8f08ffd7a96219f748ef14d7ad4f8.','info:regioninfo'

delete 'hbase:meta','INDEX_11,5479_0041431700000000040100004815E9,1429757926776.73ab00eaa7bab7bc83f440549b9749a3.','info:regioninfo'

刪除兩個重複的hdfs

/hbase/data/default/INDEX_11/b0c8f08ffd7a96219f748ef14d7ad4f8 /hbase/data/default/INDEX_11/73ab00eaa7bab7bc83f440549b9749a3

對應的重啓regionserver（只是爲了刷新hmaster上彙報的RIS的狀態）

肯定會丟數據，把沒有上線的重複region上的數據丟失

2|81.8 新hbase hbck

 

新版的hbck 新版本的 hbck 可以修復各種錯誤，修復選項是：

（1）-fix，向下兼容用，被-fixAssignments替代

（2）-fixAssignments，用於修復region assignments錯誤

（3）-fixMeta，用於修復meta表的問題，前提是HDFS上面的region info信息有並且正確。

（4）-fixHdfsHoles，修復region holes（空洞，某個區間沒有region）問題

（5）-fixHdfsOrphans，修復Orphan region（hdfs上面沒有.regioninfo的region）

（6）-fixHdfsOverlaps，修復region overlaps（區間重疊）問題

（7）-fixVersionFile，修復缺失hbase.version文件的問題

（8）-maxMerge <n> （n默認是5），當region有重疊是，需要合併region，一次合併的region數最大不超過這個值。 （9）-sidelineBigOverlaps ，當修復region overlaps問題時，允許跟其他region重疊次數最多的一些region不參與（修復後，可以把沒有參與的數據通過bulk load加載到相應的region）

（10）-maxOverlapsToSideline <n> （n默認是2），當修復region overlaps問題時，一組裏最多允許多少個region不參與 由於選項較多，所以有兩個簡寫的選項

（11） -repair，相當於-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans -fixHdfsOverlaps -fixVersionFile -sidelineBigOverlaps

（12）-repairHoles，相當於-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans

 

新版本的 hbck

（1）缺失hbase.version文件 加上選項 -fixVersionFile 解決

（2）如果一個region即不在META表中，又不在hdfs上面，但是在regionserver的online region集合中 加上選項 -fixAssignments 解決

（3）如果一個region在META表中，並且在regionserver的online region集合中，但是在hdfs上面沒有 加上選項 -fixAssignments -fixMeta 解決，（ -fixAssignments告訴regionserver close region），（ -fixMeta刪除META表中region的記錄）

（4）如果一個region在META表中沒有記錄，沒有被regionserver服務，但是在hdfs上面有 加上選項 -fixMeta -fixAssignments 解決，（ -fixAssignments 用於assign region），（ -fixMeta用於在META表中添加region的記錄）

（5）如果一個region在META表中沒有記錄，在hdfs上面有，被regionserver服務了 加上選項 -fixMeta 解決，在META表中添加這個region的記錄，先undeploy region，後assign

（6）如果一個region在META表中有記錄，但是在hdfs上面沒有，並且沒有被regionserver服務 加上選項 -fixMeta 解決，刪除META表中的記錄

（7）如果一個region在META表中有記錄，在hdfs上面也有，table不是disabled的，但是這個region沒有被服務 加上選項 -fixAssignments 解決，assign這個region

（8）如果一個region在META表中有記錄，在hdfs上面也有，table是disabled的，但是這個region被某個regionserver服務了 加上選項 -fixAssignments 解決，undeploy這個region

（9）如果一個region在META表中有記錄，在hdfs上面也有，table不是disabled的，但是這個region被多個regionserver服務了 加上選項 -fixAssignments 解決，通知所有regionserver close region，然後assign region

（10）如果一個region在META表中，在hdfs上面也有，也應該被服務，但是META表中記錄的regionserver和實際所在的regionserver不相符 加上選項 -fixAssignments 解決

（11）region holes 需要加上 -fixHdfsHoles ，創建一個新的空region，填補空洞，但是不assign 這個 region，也不在META表中添加這個region的相關信息

（12）region在hdfs上面沒有.regioninfo文件 -fixHdfsOrphans 解決

（13）region overlaps 需要加上 -fixHdfsOverlaps

 

說明： （1）修復region holes時，-fixHdfsHoles 選項只是創建了一個新的空region，填補上了這個區間，還需要加上-fixAssignments -fixMeta 來解決問題，（ -fixAssignments 用於assign region），（ -fixMeta用於在META表中添加region的記錄），所以有了組合拳 -repairHoles 修復region holes，相當於-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans

（2） -fixAssignments，用於修復region沒有assign、不應該assign、assign了多次的問題

（3）-fixMeta，如果hdfs上面沒有，那麼從META表中刪除相應的記錄，如果hdfs上面有，在META表中添加上相應的記錄信息 （4）-repair 打開所有的修復選項，相當於-fixAssignments -fixMeta -fixHdfsHoles -fixHdfsOrphans -fixHdfsOverlaps -fixVersionFile -sidelineBigOverlaps 新版本的hbck從（1）hdfs目錄（2）META（3）RegionServer這三處獲得region的Table和Region的相關信息，根據這些信息判斷並repair

2|91.9 meta表手動刪除表

 

因爲集羣硬盤緊俏，絕對對原來的表加上COMPRESSION=>LZO屬性。但是創建表，長時間沒有反饋。決定drop掉這張表，但是始終drop失敗。重啓集羣，hbase 16010界面顯示有region transaction。爲創建失敗的表region，在PENDING_OPEN和CLOSED之間跳。describe 表失敗， enable表失敗，disable表失敗，從60010界面查看錶失敗。很蛋疼。 後決定強制刪除當前表。google了一下，找到這篇文章，文章大部分都是對的，但是最後一步存在問題.原文中命令爲： delete 'Hbase:meta','TrojanInfo,,1361433390076.2636b5a2b3d3d08f23d2af9582f29bd8.','info:server'

命令成功執行。

重啓集羣后，transction仍然存在，分析應該是meta表沒有更新的問題，對meta表做一次major_compact，重啓集羣，成功。不再有報錯。 下面是對原文的拷貝：

強制刪除表：

1、強制刪除該表在hdfs上的所有文件(路徑根據實際情況而定）： [sql] view plaincopy ./hadoop fs -rmr /hbase/TrojanInfo

2、刪除該表在HBase系統表.META.中的記錄：

A、首先從.META.中查詢出表 TrojanInfo在.META.中的rowkey，這可以通過scan 'Hbase:meta'，然後手動篩選；

B、然後刪除該rowkey下的3個字段（假設查詢出的rowkey爲TrojanInfo,,1361433390076.2636b5a2b3d3d08f23d2af9582f29bd8.） delete 'TrojanInfo','TrojanInfo,,1361433390076.2636b5a2b3d3d08f23d2af9582f29bd8.','info:server' delete 'TrojanInfo','TrojanInfo,,1361433390076.2636b5a2b3d3d08f23d2af9582f29bd8.','info:serverstartcode' delete 'TrojanInfo','TrojanInfo,,1361433390076.2636b5a2b3d3d08f23d2af9582f29bd8.','info:reg

2|101.9 轉meta表修復三

 

一、故障原因
IP爲10.191.135.3的服務器在2013年8月1日出現服務器重新啓動的情況，導致此臺服務器上的所有服務均停止。從而造成NTP服務停止。當NTP服務停止後，導致HBase集羣中大部分機器時鐘和主機時間不一致，造成regionserver服務中止。並在重新啓動後，出現region的hole。需要對數據進行重新修復，以正常提供插入數據的服務。

二、恢復方式
1、集羣50個regionserver，宕掉服務41個，namenode所在機器10.191.135.3不明重啓（原因查找中）導致本機上的namenode、zookeeper、時間同步服務器服務掛掉。
2、重啓hbase服務時，沒能成功stop剩餘的9個regionserver服務，進行了人爲kill進程，
3、在hdfs上移走了hlog（避免啓動時split log花費過多時間影響服務），然後重啓hbase。發現10.191.135.30機器上的時間與時間同步服務器10.191.135.3不同步。手工同步後重啓成功。hbase可以正常提供查詢服務。
4、運行mapreduce put數據。拋出異常，數據無法正常插入；
5、執行/opt/hbase/bin/hbase hbck -fixAssignments，嘗試重新分配region。結果顯示hbase有空洞，即region之間數據不連續了；
6、通過上述操作可以定位是在regionserver服務宕掉的後重啓的過程中丟了數據。需要進行空洞修復。然而hbase hbck命令總是隻顯示三條空洞。
7、通過編寫的regionTest.jar工具進行進一步檢測出空洞所在的regionname然後停掉hbase，進而進行region合併修復空洞;
8、合併的merge 操作需要先去.META.表裏讀取該region的信息，由於.META.表也在regionserver宕機過程中受到損壞，所以部分region的.META.信息沒有，merge操作時就拋出空指針異常。因此只能將hdfs這些region進行移除，然後通過regionTest.jar 檢測新的空洞所在的regionname，進行合併操作修復空洞；
9、關於region重疊，即regionname存在.META.表內，但是在hdfs上被錯誤的移出，並進行了region合併。這種情況下需要通過regionTest.jar檢測重疊的regionname然後手動去.META.表刪除，.META.表修改之後需要flush；
10、最後再次執行 hbase hbck 命令，hbase 所有表status ok。
三、相關命令及頁面報錯信息

1.手工同步時間命令
service ntpd stop
ntpdate -d 192.168.1.20
service ntpd start 2.org.apache.hadoop.hbase.client.RetriesExhaustedWithDetailsException: Failed 2 actions: WrongRegionException: 2 times, servers with issues: datanode10:60020, 
at org.apache.hadoop.hbase.client.HConnectionManager$HConnectionImplementation.processBatchCallback(HConnectionManager.java:1641)
at org.apache.hadoop.hbase.client.HConnectionManager$HConnectionImplementation.processBatch(HConnectionManager.java:1409)
at org.apache.hadoop.hbase.client.HTable.flushCommits(HTable.java:949)
at org.apache.hadoop.hbase.client.HTable.doPut(HTable.java:826)
at org.apache.hadoop.hbase.client.HTable.put(HTable.java:801)
at org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.TableOutputFormat$TableRecordWriter.write(TableOutputFormat.java:123)
at org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.TableOutputFormat$TableRecordWriter.write(TableOutputFormat.java:84)
at org.apache.hadoop.mapred.MapTask$NewDirectOutputCollector.write(MapTask.java:533)
at org.apache.hadoop.mapreduce.task.TaskInputOutputContextImpl.write(TaskInputOutputContextImpl.java:88)
at o 3.13/08/01 18:30:02 DEBUG util.HBaseFsck: There are 22093 region info entries
ERROR: There is a hole in the region chain between [phone]cmnet201303072132166264580 and [phone]. You need to create a new .regioninfo and region dir in hdfs to plug the hole.
ERROR: There is a hole in the region chain between [phone]cmwap20130512235639430 and [phone]cmnet201305040821436779670. You need to create a new .regioninfo and region dir in hdfs to plug the hole.
ERROR: There is a hole in the region chain between [phone]cmnet201212271719506311400 and [phone]cmnet201302131646431671140. You need to create a new .regioninfo and region dir in hdfs to plug the hole.
ERROR: Found inconsistency in table cqgprs
Summary:
 -ROOT- is okay.
 Number of regions: 1
 Deployed on: datanode14,60020,1375330955915
 .META. is okay.
 Number of regions: 1
 Deployed on: datanode21,60020,1375330955825
 cqgprs is okay.
 Number of regions: 22057
 Deployed on: datanode1,60020,1375330955761 datanode10,60020,1375330955748 datanode11,60020,1375330955736 datanode12,60020,1375330955993 datanode13,60020,1375330955951 datanode14,60020,1375330955915 datanode15,60020,1375330955882 datanode16,60020,1375330955892 datanode17,60020,1375330955864 datanode18,60020,1375330955703 datanode19,60020,1375330955910 datanode2,60020,1375330955751 datanode20,60020,1375330955849 datanode21,60020,1375330955825 datanode22,60020,1375334479752 datanode23,60020,1375330955835 datanode24,60020,1375330955932 datanode25,60020,1375330955856 datanode26,60020,1375330955807 datanode27,60020,1375330955882 datanode28,60020,1375330955785 datanode29,60020,1375330955799 datanode3,60020,1375330955778 datanode30,60020,1375330955748 datanode31,60020,1375330955877 datanode32,60020,1375330955763 datanode33,60020,1375330955755 datanode34,60020,1375330955713 datanode35,60020,1375330955768 datanode36,60020,1375330955896 datanode37,60020,1375330955884 datanode38,60020,1375330955918 datanode39,60020,1375330955881 datanode4,60020,1375330955826 datanode40,60020,1375330955770 datanode41,60020,1375330955824 datanode42,60020,1375449245386 datanode43,60020,1375330955880 datanode44,60020,1375330955902 datanode45,60020,1375330955881 datanode46,60020,1375330955841 datanode47,60020,1375330955790 datanode48,60020,1375330955848 datanode49,60020,1375330955849 datanode5,60020,1375330955880 datanode50,60020,1375330955802 datanode6,60020,1375330955753 datanode7,60020,1375330955890 datanode8,60020,1375330955967 datanode9,60020,1375330955948
 test1 is okay.
 Number of regions: 1
 Deployed on: datanode43,60020,1375330955880
 test2 is okay.
 Number of regions: 1
 Deployed on: datanode21,60020,1375330955825
35 inconsistencies detected.
Status: INCONSISTENT 4.hadoop jar regionTest.jar com.region.RegionReaderMain /hbase/cqgprs 檢測cqgprs表裏的空洞所在的regionname。 5.==================================
first endKey = [phone]cmnet201307102326567966800
second startKey = [phone]cmnet201212251545557984830

first regionNmae = cqgprs,[phone]cmnet201212251545557984830,1375241186209.0f8266ad7ac45be1fa7233e8ea7aeef9.
second regionNmae = cqgprs,[phone]cmnet201212251545557984830,1362778571889.3552d3db8166f421047525d6be39c22e.
==================================
first endKey = [phone]cmnet201303051801355846850
second startKey = [phone]cmnet201307102326567966800

first regionNmae = cqgprs,[phone]cmnet201212251545557984830,1362778571889.3552d3db8166f421047525d6be39c22e.
second regionNmae = cqgprs,[phone]cmnet201307102326567966800,1375241186209.09d489d3df513bc79bab09cec36d2bb4.
================================== 6.Usage: bin/hbase org.apache.hadoop.hbase.util.Merge [-Dfs.default.name=hdfs://nn:port] <table-name> <region-1> <region-2>

./hbase org.apache.hadoop.hbase.util.Merge -Dfs.defaultFS=hdfs://bdpha cqgprs cqgprs,[phone]cmnet201305251243290802280,1369877465524.3c13b460fae388b1b1a70650b66c5039. cqgprs,[phone]cmnet201302141725552206710,1369534940433.5de80f59071555029ac42287033a4863. & 7.13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: Naming new problem group: [phone]cmnet201212290358070667800
ERROR: (regions cqgprs,[phone]cmnet201304131404096748520,1375363774655.b3cf5cc752f4427a4e699270dff9839e. and cqgprs,[phone]cmnet201212290358070667800,1364421610707.7f7038bfbe2c0df0998a529686a3e1aa.) There is an overlap in the region chain.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: reached end of problem group: [phone]cmnet201302182135452100210
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: Naming new problem group: [phone]cmnet201302031921019768070
ERROR: (regions cqgprs,[phone]cmnet201306170027424674330,1375363962312.9d1e93b22cec90fd75361fa65b1d20d2. and cqgprs,[phone]cmnet201302031921019768070,1360873307626.f631cd8c6acc5e711e651d13536abe94.) There is an overlap in the region chain.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: reached end of problem group: [phone]cmnet201212270713444340110
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: Naming new problem group: [phone]cmnet201306010239025175240
ERROR: (regions cqgprs,[phone]cmnet201306091923411365860,1375364143678.665dba6a14ebc9971422b39e079b00ae. and cqgprs,[phone]cmnet201306010239025175240,1372821719159.6d2fecc1b3f9049bbca83d84231eb365.) There is an overlap in the region chain.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: reached end of problem group: [phone]cmnet201306012336364819810
ERROR: There is a hole in the region chain between [phone]cmwap20130512235639430 and [phone]cmnet201305040821436779670. You need to create a new .regioninfo and region dir in hdfs to plug the hole.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: Naming new problem group: [phone]cmnet201301191433522129820
ERROR: (regions cqgprs,[phone]cmnet201301300708363045080,1375364411992.4ee5787217c1da4895d95b3b92b8e3a2. and cqgprs,[phone]cmnet201301191433522129820,1362003066106.70b48899cc753a0036f11bb27d2194f9.) There is an overlap in the region chain.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: reached end of problem group: [phone]cmnet201301051742388948390
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: Naming new problem group: [phone]cmnet201301031139206225900
ERROR: (regions cqgprs,[phone]cmnet201301250809235976320,1375364586329.40eed10648c9a43e3d5ce64e9d63fe00. and cqgprs,[phone]cmnet201301031139206225900,1361216401798.ebc442e02f5e784bce373538e06dd232.) There is an overlap in the region chain.
13/08/01 22:24:02 WARN util.HBaseFsck: reached end of problem group: [phone]cmnet201302122009459491970
ERROR: There is a hole in the region chain between [phone]cmnet201212271719506311400 and [phone]cmnet201302131646431671140. You need to create a new .regioninfo and region dir in hdfs to plug the hole. 8. delete '.META.','regionname','info:serverstartcode' delete '.META.','regionname','info:regionserver' delete '.META.','regionname','info:regioninfo' 9. flush '.META.'
major_compact '.META.'