【轉載】SimpleITK學習--基本概念

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SimpleITK是ITK的簡化接口,使用起來更加方便,有多種語言接口,我平時用的都是python版,安裝比較簡單,pip install SimpleITK即可

SimpleITK是專門處理醫學影像的軟件,在SimpleITK中,圖像的概念與我們在計算機視覺中常用的RGB圖像差異很大,後者只是一個多維矩陣,是一個數學上的概念,而在SimpleITK中,圖像是一種物理實體,圖像中的每一個像素都是物理空間中的一個點,不光有着像素值,還有着座標,間距,方向等概念

下圖是一個直觀的解釋

size:圖像在各維度的像素個數

spacing:圖像各維度上像素之間的距離(物理層面的,有單位,一般爲mm)

physical extent:圖像在物理空間中的大小

Origin:圖像原點的座標(物理層面的,有單位,一般爲mm,與spacing保持一致)

direction:採用方向餘弦矩陣,也就是圖像自身座標系相對於世界座標系(固定不動的)的角度,再直白點就是新座標系在原座標系上各個方向的投影,百度百科https://baike.baidu.com/item/方向餘弦

爲了強調此處的圖像不僅僅是一個數字組成的矩陣,用圖說話

兩幅圖的內容能看出來是一樣的,但是像素間距不同

再看

兩幅圖內容一樣,但是方向和座標原點都不同,在SimpleITK中是不同的圖像

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