錯誤場景
在進行TCGA-GBM數據下載時候,發生了鎖競爭?
錯誤如下:
Error in unpackPkgZip(foundpkgs[okp, 2L], foundpkgs[okp, 1L], lib, libs_only, :
ERROR: failed to lock directory ‘D:\Programme\R\R-3.6.1\library’ for modifying
Try removing ‘D:\Programme\R\R-3.6.1\library/00LOCK’
unlink(“D:/Programme/R/R-3.6.1/library/00LOCK”, recursive = TRUE)
解決方案
原理是發生鎖競爭錯誤了。
瞭解到R可以通過unlink的方式,來關閉這個鏈接,釋放這個lock文件,重新執行就沒問題啦。
unlink("D:/Programme/R/R-3.6.1/library/00LOCK", recursive = TRUE)
其中對應的地址要按照實際情況(這裏只是我本地環境)
LOCK地址
如果不知道library的路徑在哪裏,可以看RStudio的Tools-Global Option-General- R version,舉例如下。