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Wince爲Windows CE的簡稱,Wince是一種通用型操作系統。
Windows Mobile是基於Wince相同的核心，專門爲了市面上常見到的PocketPC或是Smartphone所打造的一套操作系統。
Windows Mobile包括Pocket PC、SmartPhone以及Media Centers三大平臺體系，Windows Mobile具有錄音、音視頻播放等多媒體功能。由於大多數機型支持彩色顯示，因此耗電量極大，並且由於Windows CE本身對於資源的巨大吞噬作用，所以在能耗方面Windows CE系統要明顯遜於Palm操作系統。
簡單來說，WinCE與Mobile的系統核心是一樣的，不過Windows Mobile是Microsoft專門爲了市面上常見到的PocketPC或是Smartphone所打造的一套開發環境與授權方式，一般OEM公司如果想要加入生產PocketPC或是Smartphone的行列，就必須與Microsoft特別簽訂相關授權，至於產品的外觀與內含的軟件核心，都是由Microsoft建議，量產之前也必須通過Microsoft的認證，方能貼上Microsoft標籤出售。
至於Windows CE則不限定於PocketPC或是Smartphone的產品，一般公司可以自由運用在許多方面，可以自由選擇Windows CE中的套件組合，如果選擇Core版，授權費是3塊錢美金，量產出貨也不一定要通過Microsoft的認證。
比較Windows CE和Mobile
。去掉了原有的word、excel、pdf、ppt、image的文件瀏覽器和有word編輯功能的Wordpad應用程序，新增加了Pocket Word、Pocket Excel、Picture和Microsoft Reader應用程序，新應用相比原來文件瀏覽器功能更強，而且多數都有不同程度的編輯功能，不僅僅是瀏覽。
。新增加了全功能的Outlook應用：email client、calendar、contacts、tasks、notes，另外還有calculator。WinCE中僅有一個名爲Inbox的email client。
。Mobile中新增一個Phone Application，這是一個全功能的電話應用程序，除通話功能外，還包括：從聯繫人列表中呼叫、短消息服務、呼叫轉接、SIM卡聯繫人管理、對GSM、GPRS和CDMA的支持。另外還有一個Cellcore層，這是一個編程接口，可簡化Mobile應用程序開發。
。Mobile不支持ICS、Network Utility、SNMP、UPnP、SMB/CIFS、FTP server、File server、print server、telnet server、RAS server、SNTP。
。多媒體功能大大減弱，不支持DirectX，音頻僅支持waveform、mp3和wma三種格式，視頻格式全部不支持（這裏指沒有現成的codec可用，但並不妨礙用戶自己實現），但Windows Media Player仍可用。
。 Mobile使用一個稱爲Optimized Mobile hand-held shell，不支持Standard Shell、Taskman Shell、Windows thin client shell和Command Shell。而且Mobile不支持MUI和用戶自定義Shell。
。 Mobile不支持Kerberos認證，不支持智能卡加密。
。Mobile只支持Pocket IE，不支持IE 6.0。
。Mobile僅支持ARM架構的CPU。
。Mobile不支持鼠標。
另：
雖然Smartphone和Pocket PC Phone手機都是基於微軟WindowsCE系統的產品，由於在基本設計出發點不同，所以操作、應用程序上也有所不同。它們的軟件不能通用，操作上 PPC手機一般是採用觸摸屏操作，而Smartphone手機只能使用手機的按鍵來操作。
PPC爲Pocket PC的簡稱,PPC是Wince的一個定製版本,主要應用於PDA和手機,採用觸摸屏操作,絕大部分都沒有鍵盤.
SmartPhone也可以簡稱爲SP,SP也是Wince的一個定製版本,只能應用於手機,沒有觸摸屏,只能用鍵盤操作.
總的來說,先有Wince,然後纔有PPC和SmartPhone,他們的內核是相同的,但界面不同.