指的是加密和解密使用不同的祕鑰。
一把作爲公開的公鑰，另一把作爲私鑰。這對密鑰中的公鑰進行加密，私鑰用於解密。反之亦然（被私鑰加密的數據也可以被公鑰解密) 。
在實際使用中私鑰一般保存在發佈者手中，是私有的不對外公開的，只將公鑰對外公佈，就能實現只有私鑰的持有者才能將數據解密的方法。 這種加密方式安全係數很高，因爲它不用將解密的密鑰進行傳遞，從而沒有密鑰在傳遞過程中被截獲的風險，而破解密文幾乎又是不可能的。
但是算法的效率低，所以常用於很重要數據的加密，常和對稱配合使用，使用非對稱加密的密鑰去加密非對稱對稱加密的密鑰。
事實上，**公鑰加密算法很少用於數據加密，它通常只是用來做身份認證**，因爲它的密鑰太長，加密速度太慢--公鑰加密算法的速度甚至比對稱加密算法的速度慢上3個數量級（1000倍）。
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