SuperTarget数据库详解

原創 褚骏逸 2020-06-19 05:18

SuperTarget：http://insilico.charite.de/supertarget/index.php

SuperTarget是一个收集有关药物-靶点关系的信息的数据库。 SuperTarget整合了DrugBank, BindingDB and SuperCyp。

它主要由三种不同类型的实体组成：

  • 药物：BindingDB映射并整合到SuperTarget，并分配元数据作为ATC-codes (Anatomical Therapeutic Chemical)、结构信息和结合亲和力。
  • 蛋白质：从UniProt中提取，同时提供Targets间相互作用，序列相似性，PDB三维结构，EC编号。
  • 副作用：从SIDER中提取的。

除此之外，还可以获得关于pathways和ontologie的信息。有单独的章节专门介绍了一组特殊的靶点——细胞色素p450。

 

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