Python是一门真正意义上的编程语言，除了编写脚本，用于数值计算之外，还可以编写命令行程序，绘图，调用C，C++以及Fortran等语言的函数库等等。Python比R的应用领域更广阔，除了为黑客提供各种黑科技外，还广泛应用在化学、物理、天文、生物信息等领域，这么强大的语言，非常值得了解和学习。最要命的是，很多Python的项目是开源的，也就是源代码可以下载，供大家仔细研究。Python的另外一个好处就是可以在不同的平台上使用，也可以编译为独立的程序运行。Python脚本也可以用来驱动MySQL,sqlite, ArcGIS, Adobe Indesign等软件，进行二次开发。 Python资源极为丰富，有数以万计的程序包， 其中不乏生物信息学软件包。Biopython就是其中之一。BioPython程序包的一些函数可以对DNA序列进行复杂操作，实现对GenBank的访问和查询等。Python的语法简洁，通俗易懂， 很容易上手。 Python还有pip程序包管理系统，编写程序包也极为方便。掌握了Python，就掌握了这些资源。Python的语言的覆盖面很广，几乎是我们能想到的脚本语言能做的事情，Python都是可以做到的。
学习计算机语言，都是有助于培养好的思维习惯与严谨的态度。在编程过程中，错一个标点符号都是不行的。与此同时， 学习编程还要理解很多抽象的概念，比如S3、S4方法，面向对象、继承、多态性，也需要理解一些数学和统计学的内容，最小二乘法、极大似然、贝叶斯统计、非参数统计以及线性和混合模型等等。
将一个问题分解为能用程序解决的问题，需要化整为零，一步一步思考，然后步步为营，这样从技术上问题也许就解决了。然而发现新知识，提出新观点，已经不是技术问题，是编程所不能回答的。这时候就需要将各种信息进行整合，深刻把握问题的本质，进行深入思考。编程的能力再强，如果没有纵深的思考，没有对问题的全局性把握，没有从具体的学术问题出发，就很容易停留在技术层面，难有深刻的见解。无论是学习Python还是其他语言，这个问题都需要仔细考虑的。