文件系統
首先注意：文件系統對應的是分區，而不是硬盤格式。
舉個通俗的比喻，一塊硬盤就像一個塊空地，文件就像不同的材料，我們首先得在空地上建起倉庫(分區)，並且指定好(格式化)倉庫對材料的管理規範(文件系統)，這樣才能將材料運進倉庫保管。
文件不會受所在分區的文件系統影響，就像同樣是汽車輪胎在A倉庫可能直接堆在地上，而B倉庫則會掛在牆上，僅僅是放置和管理方法不同而已，因此，在NTFS分區和FAT32分區的文件可以隨意在分區間移動，內容不會因此產生任何不同。
文件系統，是系統對文件的存放排列方式。不同格式的文件系統關係到數據是如何在磁盤進行存儲，文件名、文件權限和其他屬性也存在不同。一塊沒有被格式化過的硬盤，可以比喻成一間沒有擺放商品的超市大賣場，在擺放商品 之前，總要先按商品類別分好區域，並安裝好貨架吧。磁盤的分區、格式化操作就相當於超市大賣場的劃分商品區域和安裝貨架了。Windows操作系統支持 FAT32, NTFS, exFAT三種不同文件系統。
①FAT32是一種相對老舊的文件系統，不能像NTFS格式支持很多現代文件格式的屬性，但對於不同系統平臺具有良好的兼容性，可以在Linux、Mac或Android系統平臺上通用。
②NTFS是目前Windows系統中一種現代文件系統，目前使用最廣泛，內置的硬盤大多數都是NTFS格式。
③exFAT是FAT32文件格式的替代品，是Microsoft在Windows Embeded 5.0以上（包括Windows CE 5.0、6.0、 Windows Mobile5、6、6.1）中引入的一種適合於閃存的文件系統，爲了解決FAT32等不支持4G及其更大的文件而推出。很多設備和操作系統都支持該文件系統，但是目前用的不多。
1. FAT32
通常U盤基本都是FAT32格式的，只是它的兼容性比較好一些，幾乎目前所有的主流系統對該格式進行讀寫，但是它的安全性不高，不能設置權限，磁盤的利用效率也比較低，關鍵是對單個文件容量有所限制，拷貝大小不能超過4GB容量，而文件名稱長度也不能超過255字符。由於U盤的容量越來越大，不建議FAT32格式。
我們在拷貝文件的時候，如果文件容量超過了4GB容量大小，那麼系統就會提示“文件過大”的提示，無法完成拷貝的情況。
它的優點是：兼容性好。在一個不超過8GB 的分區中，FAT32分區格式的每個簇容量都固定爲4KB，與FAT16相比，可以大大地減少磁盤的浪費，提高磁盤利用率。
它的缺點是：當文件刪除後寫入新資料，FAT不會將檔案整理成完整片段再寫入，長期使用後會使檔案資料變得逐漸分散，而減慢了讀寫速度。硬盤碎片整理是一種解決方法，但必須經常整理來保持FAT文件系統的效率。還有就是FAT32分區因爲設計缺陷,無法支持超過4GB的單個文件，不支持512MB以下容量的U盤。
2. NTFS
NTFS目前是使用最爲廣泛的分區類型，我們可以進行設置權限，並且比Fat32多出許多功能，並且在安全性和易用性、穩定性方面出色。它是由Win 2000之後開始普及，如今發展到現在NTFS最大支持256TB（MBR），而GPT分區下更是最大支持128EB。
目前大多數的電腦硬盤都是使用NTFS，我們在分區的時候建議首選NTFS分區類型，U盤不建議使用NTFS，會大幅度縮短壽命。
由於NTFS分區類型是微軟公司的專利，因此對於Mac用戶或多或少有點小麻煩，MAC用戶需要藉助第三方軟件纔可以寫入NTFS文件系統，所以如果考慮多平臺的用戶，我們更加推薦exFAT格式。
它的優點是：兼容性好。ntfs格式最大的優點是可以支持4G以上至2T的文件進行傳輸，在傳輸速度上它也有着較爲明顯的優勢。
它的缺點是：NTFS雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬盤而設計的，對於新興的Flash 閃存材料不一定適用。NTFS分區是採用“日誌式”的文件系統，因爲要記錄磁盤的詳細讀寫操作，對U盤這種閃存儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個 文件或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的U盤比較容易損壞，而且400MB以下的分區也比FAT16更浪費空間。ntfs的缺點主要表現在，會縮短閃存壽命，經常使用格式化、初始化u盤後會使得u盤讀取緩慢的現象。
(反正U盤超便宜，不怕壞的朋友們使用NTFS其實挺好)
3. exFAT
exFAT也可以叫做FAT64，主要針對移動存儲設備，比如閃存、U盤等。從Windows CE6之後就出現了，它解決了FAT32不支持4G以上大容量文件的問題，直接最大支持16EB（目前256GB），而Windows與Mac均可適用，還有十分強的跨平臺能力。是微軟專爲閃存（U盤、存儲卡）閃存設備設計的文件系統，兼容性非常好。建議U盤等移動設備首選。因爲FAT32格式單個文件不能超過4G，使用NTFS格式又容易損壞閃存芯片，所以纔開發EXFAT格式來解決這些問題。
它的優點是：增強臺式電腦與移動設備的相互操作能力；單文件大小最大可達16EB ;簇大小可高達32MB，同一目錄下最大文件數可達65 536個；支持訪問控制。
它的缺點是：專爲閃存和U盤設計，空間浪費小。exFAT兼容性相對較差，在xp系統中經常無法識別，在win7和win8系統中問題就不大。
4.1 FAT32與exFAT的區別
大多數優盤在格式化時選用FAT32爲默認文件系統，它最大優點就是在一個不超過8GB 的分區中，FAT32分區格式的每個簇容量都固定爲4KB，與前代相比可以大大地減少磁盤的浪費，提高磁盤利用率。
雖然對於最大分區容量的支持上面，FAT32 2TB最大分區的容量時至今日仍不過時，但FAT32無法傳輸並存放超過4GB容量的光盤ISO鏡像、高清視頻、各種圖形作品文件等等，這是其致命的弊端。
再來說說exFAT格式，exFAT文件系統在蘋果本或者是Windows電腦上都可以格式化，並且在兩個系統之間可以互相無障礙使用。相比之下，exFAT格式就沒有4GB文件傳輸限制了。
其實FAT32與exFAT格式存在着一個升級關係，這兩種文件系統都支持OS X系統與Windows系統，如果你將優盤格式化成這兩種文件系統，在不同操作系統電腦上可以暢通無阻地使用。
FAT32與exFAT之間最大的差別在於能否支持4GB及以上容量單個文件的傳輸、查看與編輯。
4.2 NTFS與FAT的區別
除了FAT文件系統以外，NTFS文件系統也是相當流行的，但多見於硬盤分區。XP、Vista、Win7默認都會將分區格式化爲NTFS系統，可以說NTFS是目前最好的磁盤文件系統。
優盤在格式化爲NTFS文件系統時，實際可用容量與其他文件系統形式也有所差別，雖然使用中感受並不是很大。
另外，在格式化優盤的過程中，容量在64G甚至是更大規格時，系統識別自動格式化爲exFAT與NTFS格式，會便於優盤在不同操作系統電腦上無障礙使用。(64G甚至更大容量優盤無法直接格式化爲FAT32)
NTFS相比FAT會讓閃存性能降低。NTFS分區是採用“日誌式”的文件系統，因爲要記錄磁盤的詳細讀寫操作，對U盤這種快閃存儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個文件或目錄，在 NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的U盤比較容易損壞。由於U盤帶寬有限，NTFS文件系統頻繁讀寫佔據通道會讓磁盤性能降低。
FAT系列文件系統與NTFS之間最大的區分在於文件存取的方式，後者長期使用可能會讓閃存類存儲產品性能降低。