linux：R的安裝和jupyter連接

前提：jupyter已經安裝好

• 安裝R

1. 使用yum的方式安裝：yum install  epel-release；sudo yum install R

報錯：【Error 256】No more mirrors to try

解決：依次執行以下語句：yum clean all；yum makecache，yum -y update；yum install  epel-release；sudo yum install R

成功：

• 安裝Rstudio：在R控制端進行
• 法一：使用以下語句安裝：install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))

報錯：

解決：找到文件Rprofile文件並添加鏡像設置：find / -name Rprofile；進入到該路徑的文件下添加：vi Rprfile

#set a CRAN mirror
    local({r <- getOption("repos")  
           r["CRAN"] <- "https://mirror.lzu.edu.cn/CRAN/"  
           options(repos=r)}) 

修改完文件運行：install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))

報錯：

部分包會安裝失敗，直接用命令重新安裝一遍即可，如果還不行，用法二試試

• 法二：

sudo apt-get install gfortran
sudo apt-get install build-essential 
sudo apt-get install libxt-dev 
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
sudo apt-get install libxml++2.6-dev
sudo apt-get install libssl-dev
sudo R  # 進入R

install.packages("devtools", dependencies = T)
library(devtools)  # 如果沒有任何提示就代表成功了

• IRkernel的安裝與激活，在R控制檯輸入以下命令

devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
IRkernel::installspec()

不報錯，則說明成功，可以看到

• 新建文件進行測試