LSF 作業管理系統

本文從本人簡書博客同步過來

在上一篇中我們簡要介紹了 PBS 作業管理系統，下面我們將介紹 LSF 作業管理系統。

簡介

LSF （Load Sharing Facility）是一個被廣泛使用的作業管理系統，具有高吞吐、配置靈活的優點。通過 LSF 集中監控和調度，可以充分利用計算機的CPU、內存、磁盤等資源。

常用命令

• bqueues：查看計算隊列
• bhosts：查看計算節點列表
• lsload：查看負載
• bsub：提交作業
• bjobs：查看作業狀態
• bkill：終止作業
• bpeek：查看作業的標準輸出
• bhist：作業歷史信息

作業提交bsub

bsub調用方法

可以通過以下三種方法使用 bsub 來提交作業：

1. 直接在命令行中輸入完整參數：
2. 進入 bsub 環境交互提交：
3. 編寫作業提交腳本供 bsub 處理。

直接輸入完整參數

可以直接在 bsub 的命令行中輸入完整的參數來提交一個作業，比如：

$ bsub -n 4 -q example-queue -o example.out ./example "-input data.txt"

其中所用的參數說明如下：

• -n 指定所需的處理器數目；
• -q 指定作業運行的隊列；
• -o 指定作業運行信息的輸出文件；
• “-input data.txt” 是傳遞給執行程序 example 的命令行參數。

這種方式比較適合提交簡單的作業，更復雜的作業控制需要編寫作業腳本。

使用作業提交腳本

LSF 作業腳本本質上也是一個 shell 腳本，在其中可以用 #BSUB開頭的行來指明 bsub作業參數。下面是一個 LSF 作業腳本示例：

# example.lsf

#BSUB -L /bin/bash
#BSUB -J example-mpi4py
#BSUB -q example-queue
#BSUB -n 4
#BSUB -o example.out
#BSUB -e example.err

mpirun python example-mpi4py.py

其中各參數說明如下：

• -L 指明所用的執行 shell，默認會調用 /bin/sh 執行腳本；
• -J 指定作業名；
• -q 指定作業隊列；
• -n 指定作業所需的進程數；
• -o 指定作業的標準輸出文件；
• -e 指定作業的錯誤輸出文件。

提交作業腳本，使用下面的命令：

$ bsub < example.lsf

交互式提交

在終端中輸入 bsub 並回車後會進入 bsub 交互環境，在其中可輸入作業參數和執行作業程序。在 bsub 交互環境下可以一次提交多個參數相同的作業，例如：

$ bsub
bsub> -n 4
bsub> -q example-queue
bsub> -o example.out
bsub> PROG1
bsub> PROG2
bsub> PROG3
bsub> Ctrl+D

使用 Ctrl+D 可退出 bsub 交互環境。

查看作業信息

可以用 bjobs 命令查看用戶正在運行中的作業：

$ bjobs

使用 -l參數和某個作業的 JOBID，可以查看該作業的詳細信息：

$ bjobs -l JOBID

中止作業

使用 bkill 命令中止某個作業：

$ bkill JOBID

以上簡要介紹了 LSF 作業管理系統，在下一篇中我們將介紹 SLURM 資源管理系統。