RNA結構分析(2)通過核苷酸序列預測二級結構

(1)RNAfold 服務器

1.輸入核苷酸序列
2.點擊運行
RNAfold web server
http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi


(2)Mfold服務器
www.unafold.org
http://www.unafold.org/
1.設置任務名
2.輸入核苷酸序列
3.點擊運行fold
4.點擊輸出頁面的vienna,得到‘點括號’形式的二級結構



(3)RNAstructure 服務器
Welcome to the Predict a Secondary Structure Web Server
https://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/Servers/Predict1/Predict1.html

1.設置任務名
2.輸入核苷酸序列
3.點擊運行





(4)Vfold2D服務器

Vfold2D
http://rna.physics.missouri.edu/vfold2D/
1.設置任務名
2.輸入核苷酸序列,輸入郵箱
3.點擊運行
4.點擊模型,生成二級結構‘點括號’


(5)Centroid-Fold服務器
CentroidFold
http://rtools.cbrc.jp/centroidfold/
1.輸入核苷酸序列
2.點擊運行
3.計算結束後點擊txt,即可得到‘點括號’形式的二級結構


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