(1)RNAfold 服务器
1.输入核苷酸序列
2.点击运行
RNAfold web server
http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi
(2)Mfold服务器
www.unafold.org
http://www.unafold.org/
1.设置任务名
2.输入核苷酸序列
3.点击运行fold
4.点击输出页面的vienna,得到‘点括号’形式的二级结构
(3)RNAstructure 服务器
Welcome to the Predict a Secondary Structure Web Server
https://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/Servers/Predict1/Predict1.html
1.设置任务名
2.输入核苷酸序列
3.点击运行
(4)Vfold2D服务器
Vfold2D
http://rna.physics.missouri.edu/vfold2D/
1.设置任务名
2.输入核苷酸序列,输入邮箱
3.点击运行
4.点击模型,生成二级结构‘点括号’
(5)Centroid-Fold服务器
CentroidFold
http://rtools.cbrc.jp/centroidfold/
1.输入核苷酸序列
2.点击运行
3.计算结束后点击txt,即可得到‘点括号’形式的二级结构