RNA结构分析(2)通过核苷酸序列预测二级结构

(1)RNAfold 服务器

1.输入核苷酸序列
2.点击运行
RNAfold web server
http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi


(2)Mfold服务器
www.unafold.org
http://www.unafold.org/
1.设置任务名
2.输入核苷酸序列
3.点击运行fold
4.点击输出页面的vienna,得到‘点括号’形式的二级结构



(3)RNAstructure 服务器
Welcome to the Predict a Secondary Structure Web Server
https://rna.urmc.rochester.edu/RNAstructureWeb/Servers/Predict1/Predict1.html

1.设置任务名
2.输入核苷酸序列
3.点击运行





(4)Vfold2D服务器

Vfold2D
http://rna.physics.missouri.edu/vfold2D/
1.设置任务名
2.输入核苷酸序列,输入邮箱
3.点击运行
4.点击模型,生成二级结构‘点括号’


(5)Centroid-Fold服务器
CentroidFold
http://rtools.cbrc.jp/centroidfold/
1.输入核苷酸序列
2.点击运行
3.计算结束后点击txt,即可得到‘点括号’形式的二级结构


發表評論
所有評論
還沒有人評論,想成為第一個評論的人麼? 請在上方評論欄輸入並且點擊發布.
相關文章