1.使用MyISAM而不是InnoDB
MySQL有很多数据库引擎，但是你最可能碰到的就是MyISAM和InnoDB。 MySQL默认使用的是MyISAM。但是，很多情况下这都是一个很糟糕的选择，除非你在创建一个非常简单抑或实验性的数据库。
外键约束或者事务处理对于数据完整性是非常重要的，但MyISAM都不支持这些。另外，当有一条记录在插入或者更新时，整个数据表都被锁定了，当使用量增加的时候这会产生非常差的运行效率。 结论很简单：使用InnoDB。
2.使用PHP的mysql函数
PHP 自产生之日就提供了MySQL库函数（or near as makes no difference）。很多应用仍然在使用类似mysql_connect、mysql_query、mysql_fetch_assoc等的函数，尽 管PHP手册上说：如果你在使用MySQL v4.1.3或者更新版本，强烈推荐使用您使用mysql展。
mysqli（MySQL的加强版扩展）有以下几个优点：
可选的面向对象接口
prepared表达式，这有利于阻止SQL注入攻击，还能提高性能
支持更多的表达式和事务处理
另外，如果你想支持多种数据库系统，你还可以考虑PDO。
3.没有处理用户输入
这或者可以这样说#1：永远不要相信用户的输入。用服务器端的PHP验证每个字符串，不要寄希望与JavaScript。
最简单的SQL注入攻击会利用如下的代码：
$username = $_POST[''name'']; $password = $_POST[''password'']; $sql = ''SELECT userid FROM usertable WHERE username='$username' AND password='$password';''; // run query...
只要在username字段输入“admin';--”，这样就会被黑到，相应的SQL语句如下：
SELECT userid FROM usertable WHERE username='admin';
狡猾的黑客可以以admin登录，他们不需要知道密码，因为密码段被注释掉了