你可以按照以下步骤在 Linux 系统中安装 Nginx 并指定安装目录：
1. 首先，打开终端并以管理员身份登录到 Linux 系统。
2. 创建一个新的目录来存储 Nginx 安装文件。例如，可以创建 `/usr/local/src` 目录：
```
sudo mkdir -p /www/server/
cd /www/server/
```
3. 到 Nginx 的官方网站下载最新版本的 Nginx 安装包，并将其保存到刚刚创建的目录中。可以使用 `wget` 命令下载：
```
sudo wget http://nginx.org/download/nginx-X.X.X.tar.gz -P /www/server/nginx
```
注意，将 `X.X.X` 替换为实际的 Nginx 版本号。
4. 解压缩下载的文件，并修改文件名：
```
sudo tar -zxvf /usr/local/src/nginx-X.X.X.tar.gz -C /www/server/
sudo mv nginx-X.X.X nginx
```
5. 进入解压后的 Nginx 文件夹：
```
cd /www/server/nginx/
```
6. 配置 Nginx 的安装路径：
```
sudo ./configure --prefix=/www/server/nginx
```
注意，`/usr/local/nginx` 是 Nginx 的安装目录，也可以替换为你想要的目录。
7. 编译和安装 Nginx：
```
sudo make && sudo make install
```
8. 这时，Nginx 已经安装好了。你可以使用以下命令启动它：
```
sudo /www/server/nginx
```
如果需要停止 Nginx，可以使用以下命令：
```
sudo /www/server/nginx -s stop
```
如果需要重新加载配置文件而不停止 Nginx，可以使用以下命令：
```
sudo /www/server/nginx -s reload
```
注意，以上命令中的路径可能因为 Nginx 版本更新而有所变化，请根据实际情况适当修改。