原创 虛擬機ubuntu14.04編譯MPI版本NAMD
最近,嘗試用ubuntu編譯NAMD,由於以前對NAMD完全未接觸過,也不懂該專業的相關知識,因此作爲一個外行人嘗試編譯NAMD,這裏記錄一下粗略過程: 1.首先,需要搭建MPI並行環境:http://blog.csdn.net/xiao
原创 libsvm最新源代碼(版本3.21)理解解析(二)
一、回顧 上節,我們介紹到了SMO的總體過程,本節對SMO的三個難點結合代碼進行詳細分析。 二、SMO算法 (1)設置拉格朗日乘子α=(α[1]...α[i]...α[l])的初始值(一般設爲全0),並設置迭代次數計數器k=1。 (2)如
原创 Ubuntu(14.04.1)配置MPI多機並行環境(虛擬機)詳細步驟
虛擬機中配置MPI多機環境與PC中基本相同,但會有許多不同之處,連同配置時經常出現的錯誤和解決方法在此記錄。 步驟: 1.準備: 首先需要搭建多個虛擬機,即建立虛擬機,不同數量的虛擬機搭建過程基本相似(省略虛擬機安裝步驟),同時需要保證虛
原创 虛擬機ubuntu集羣編譯安裝GROMACS(MPI版本)軟件過程
嘗試編譯安裝gromacs時遇到了不少問題,記錄一下: 1.搭建MPI並行環境:http://blog.csdn.net/xiaoqiangqiangjie/article/details/53079181。 2.閱讀官方的安裝手冊:ht
原创 libsvm最新源代碼(版本3.21)理解解析(三)
一、回顧 上篇博文,我們講述了LIBSVM的SMO算法中的三個算法。本節我們介紹LIBSVM在SMO算法中使用的其他一些技巧和算法。 二、Shrinking 當我們更新α向量的時候,很可能在循環中期,有相當多的α已
原创 libsvm最新源代碼(版本3.21)理解解析(一)
一、導讀 SVM的理論通過吳恩達(Andrew NG)的機器學習斯坦福公開課(http://open.163.com/special/opencourse/machinelearning.html)以及一些博文都可以很好的