原创 Perl 中的線程

線程概述 線程是一個單一的執行流程,它是所有程序執行過程中最小的控制單位,即能被 CPU 所調度的最小任務單元。線程與進程之間既有聯繫,又完全不同。簡單地說,一個線程必然屬於某一個進程,而一個進程包含至少一個或者多個線程。早期的計算機系統

原创 R 卡方和fisher

> x <- c(1,1,13,8,39,13,42,12,51,12)> y <- dim(2,5) >fisher.test(x) >chisq.test(x) > y <- c(0,1,1,0,1

原创 R進行多重t檢驗

           X A 1  0.2156628 1 2  0.2871022 1 3  0.2641319 1 4  0.1095140 2 5  0.1736879 2 6  0.1380919 2 7  0.1269411 3

原创 R畫volcano plot

require(ggplot2) png("") ##Highlight genes that have an absolute fold change > 2 and a p-value < Bonfe

原创 perl中調用方法

Perl語言的強項就在於文本處理(當然主要是純文本),而恰好大多數生物信息學數據都是以純文本的形式存放的(包括蛋白質、核酸等序列文件,序列比對文件,進化樹文件等),BioPerl是爲了分析、處理這些文本數

原创 使用ensembl api鑑定假常染色體區段

PAR regions The pseudo-autosomal regions are homologous DNA sequences on the (human) X and Y chromosomes. They allow

原创 R語言常用函數

R語言常用函數 基本 一、數據管理 vector:向量 numeric:數值型向量 logical:邏輯型向量character;字符型向量 list:列表 data.frame:數據框c:連接爲向量或列表 length:求長度 subs

原创 R語言基礎和畫圖相關資料

R語言基礎和畫圖相關資料 http://www.r-project.org/ R 的官方網站  http://cran.r-project.org/manuals.html R 官方文檔  http://www.bioconductor