原创 [循證理論與實踐] meta分析系列之一: meta分析的類型

證據是循證醫學( Evidence-based medcine,EBM) 的核心,基於隨機對照試驗( RCT) 的系統評價/meta分析是當前 公認的最高級別證據。 meta分析在醫學領域應用最爲廣泛,應用最多的是對干預性的隨機對照

原创 [循證理論與實踐] meta分析系列之二: meta分析的軟件

1、編程軟件 (1)Stata Stata軟件是基於C語言的一個功能強大而又小巧玲瓏的統計分析軟件,最初由美國計算機資源中心研製,現爲stata公司的產品。 (2) R軟件 R軟件是基於S語言的一種免費開放式的統計編程環境,由a

原创 [循證理論與實踐] Meta分析系列之五:貝葉斯 Meta 分析與 WinBUGS 軟件

貝葉斯Meta分析(Bayesian Meta-Analysis)是近年來基於貝葉斯統計發展起來的一種新型的Meta分析方法,主要採用“馬爾科夫鏈—蒙特卡羅”(Markov chain Monte Carlo,MCMC)方法、使用Win

原创 從隨機過程到馬爾科夫鏈蒙特卡洛方法

1. Introduction 第一次接觸到 Markov Chain Monte Carlo (MCMC) 是在 theano 的 deep learning tutorial 裏面講解到的 RBM 用到了 Gibbs samplin

原创 [循證理論與實踐] Meta分析系列之四:觀察性研究的質量評價工具

觀察性研究(observational study)又稱非實驗性研究(non-experimental study),是指沒有加入研究人員的任何 干預(試驗的或其他方面)措施,允許事件自然發展的研究過程 ,與隨機對照試驗相比,觀察性研

原创 limma包的使用技巧

limmar package是一個功能比較全的包,既含有cDNA芯片的RAW data輸入、前處理(歸一化)功能,同時也有差異化基因分析的“線性”算法(limma: Linear Models for Microarray Data),