原创 Python數據處理從零開始----第四章（可視化）(10)二分類ROC曲線目錄

混淆矩陣 機器學習中對於分類模型常用混淆矩陣來進行效果評價，混淆矩陣中存在多個評價指標，這些評價指標可以從不同角度來評價分類結果的優劣，以下內容通過簡單的理論概述和案例展示來詳細解釋分類模型中混淆矩陣的評價指標及其用途。以上四類判別結果

2018-12-17 10:50:15 235

原创 R語言之可視化①⑥一頁多圖（2）目錄

cowplot包是ggplot2的簡單附加組件。 它旨在爲ggplot2提供一個出版物就緒的主題，這個主題需要最少量的軸標籤尺寸，情節背景等。對'ggplot2'庫的一些有用的擴展和修改。 特別是，這個軟件包可以很容易地將多個'ggplot

2018-12-14 17:00:13 1

原创 Python數據處理從零開始----第三章（pandas）①刪除列目錄

Python中pandas dataframe刪除一行或一列：drop函數 DataFrame.drop(labels=None,axis=0, index=None, columns=None, inplace=False) 在這裏默認

2018-12-14 15:15:19

原创 Python數據處理從零開始----第三章（pandas）②處理缺失數據

在實際應用中對於數據進行分析的時候，經常能看見缺失值，下面來介紹一下如何利用pandas來處理缺失值。常見的缺失值處理方式有，過濾、填充。缺失值的判斷pandas使用浮點值NaN(Not a Number)表示浮點數和非浮點數組中的缺失

2018-12-14 15:15:08 1

原创 R語言之可視化①④一頁多圖（1）目錄

這裏要分享一頁多圖其實就是指，在做了很多圖的情況下，如何將諸多圖表合理的佈局在一張大的版面上，而不是一幅一幅的導出最後在其他軟件中手動拼湊。這個技能在製作多圖儀表盤場景下，將會特別有用。還需要強調下這裏所指的一頁多圖與我們之前介紹過的分

2018-12-14 14:40:15 12

原创 Python數據處理從零開始----第四章（可視化）(9)線性相關曲線目錄

通過R語言我們可以繪製兩個變量的相關圖，我所使用的是皮爾森相關，主要的參數是：①r相關係數②P值。一般對P值的評判標準是P< 0.05 簡單的相關係數的分類 0.8-1.0 極強相關 0.6-0.8 強相關 0.4-0.6 中等程

2018-12-14 11:00:05 15

原创 R語言之可視化①③散點圖+擬合曲線目錄

散點圖一般用於展示兩個變量之間的關係（比如線性相關）例如兩個基因表達量的相關性。 cor.test(datagene2) Pearson's product-moment correlation data: data gene1 an

2018-12-14 11:00:04 2

原创 Python數據處理從零開始----第四章（可視化）(8)火山圖目錄

來源數據分別是差異基因分析的兩列指標，FoldChange和Pvalue值，根據這兩個指標，我們可以把基因分爲up，down和normal三種差異表達類型，然後使用python的seaborn程序繪製散點圖即可。最終得到想要的火山圖，相

2018-12-13 17:10:16 1

原创 R.python常見問題④（R語言添加環境變量）

添加環境變量打開環境變量對話框，控制面板>系統>高級系統設置>環境變量，選擇“Path”這個環境變量，點擊編輯，可以添加環境變量的值，添加Rscript.exe 所在的路徑。在命令行中運行 Rscript在 R 腳本文件所在的文件夾中，在空

2018-12-13 17:10:05 1

原创 R語言之可視化⑩座標系統目錄

座標系可能是ggplot2中最複雜的部分。 默認座標系是笛卡爾座標系，其中x和y位置獨立地確定每個點的位置。 還有一些偶爾有用的其他座標系統。 ggplot2可以通過coord_flip()切換x和y軸。例如，如果你想要水平箱形圖。 這

2018-12-13 16:25:13 1

原创 R語言之可視化⑨火山圖

====================================== 火山圖可以方便直觀地展示兩個樣本間基因差異表達的分佈情況。通常橫座標用log2（fold change）表示，差異越大的基因分佈在兩端，縱座標用-log10（p

2018-12-13 16:25:03 7

原创 R.python常見問題③（xgboost介紹和安裝）

如何安裝 xgboost？R語言安裝 可以直接使用install.packages（）安裝python安裝 首先在Python Extension Packages for Windows - Christoph Gohlke上下載對應

2018-12-12 16:40:11

原创 R語言之可視化⑦easyGgplot2散點圖目錄

目錄R語言之可視化①誤差棒R語言之可視化②點圖R語言之可視化③點圖續R語言之可視化④點韋恩圖upsetRR語言之可視化⑤R圖形系統R語言之可視化⑥R圖形系統續R語言之可視化⑦easyGgplot2散點圖===================

2018-12-12 16:10:05 8

原创 Python數據處理從零開始----第四章（可視化）（7）（多圖合併）目錄正文

目錄Python數據處理從零開始----第四章（可視化）①Python數據處理從零開始----第四章（可視化）②Python數據處理從零開始----第四章（可視化）③Python數據處理從零開始----第四章（可視化）④Python數據處理

2018-12-12 16:10:05

原创 R語言之可視化⑥R圖形系統續目錄

目錄R語言之可視化①誤差棒R語言之可視化②點圖R語言之可視化③點圖續R語言之可視化④點韋恩圖upsetRR語言之可視化⑤R圖形系統R語言之可視化⑥R圖形系統續======================================ggp

2018-12-12 15:45:22 6