原创 單細胞交響樂25-實戰八 Smart-seq2 胰腺細胞

劉小澤寫於2020.7.20 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂21-實戰四 批量處理並整合多個10X PBMC數據

劉小澤寫於2020.7.19 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂23-實戰六 CEL-seq

劉小澤寫於2020.7.20 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂22-實戰五 CEL-seq2

劉小澤寫於2020.7.20 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂20-實戰三 10X 未過濾的PBMC數據

劉小澤寫於2020.7.19 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂17-不同單細胞R包的數據格式相互轉換

劉小澤寫於2020.7.18 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂16-處理大型數據

劉小澤寫於2020.7.18 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂18-實戰一 Smart-seq2

劉小澤寫於2020.7.19 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂19-實戰二 STRT-Seq

劉小澤寫於2020.7.19 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂15-scRNA與蛋白丰度信息結合

劉小澤寫於2020.7.16 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂13-細胞週期推斷

劉小澤寫於2020.7.16 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂14-細胞軌跡推斷

劉小澤寫於2020.7.16 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 單細胞交響樂11-多樣本間差異分析

劉小澤寫於2020.7.10、7.15 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介

原创 單細胞交響樂12-檢測Doublet

劉小澤寫於2020.7.15 爲何取名叫“交響樂”?因爲單細胞分析就像一個大樂團,需要各個流程的協同配合 單細胞交響樂1-常用的數據結構SingleCellExperiment 單細胞交響樂2-scRNAseq從實驗到下游簡介 單細胞交響

原创 求助效應成功案例之--如何去掉匹配字符後的一連串

劉小澤寫於2020.7.13 名詞解釋:“求助效應”——來自花花。 意爲:當自己有一個問題想要問別人,但還沒得到他人答覆時,自己就會在等待期間自行探索,最終先於他人,自行解答成功 前言 今天早上想要統計一下ChIPseeker的peak