原创 材料與工程學科相關軟件

商業: ·        Materials Studio版本:6.1一代材料計算軟件。模擬的方法包括量子力學的密度泛函理論、半經驗的量化計算方法、分子力學、分子動力學以及介觀模擬方法等 ·        MedeA版本:2.1.

原创 揭示有機發光二極管混合物中電荷傳輸,發光效率和形態之間的相互作用

使用蒸發法制造的有機發光二極管(OLED)中的磷光發光材料通常與主體材料混合,其濃度爲3-15 wt%,以避免發光的濃度猝滅。在這裏,空穴遷移率和光致發光的實驗測量與使用原子非平衡分子動力學模擬模仿蒸發過程而產生的薄膜的原子級形態

原创 比較模型對蛋白質動力學的理解有多好?

蛋白質的3D結構對於理解蛋白質動力學至關重要。如果實驗確定的結構不可用,則可以使用比較模型來推斷動力學。但是,與實驗結構相比,比較模型在推斷動力學方面的有效性尚不清楚。爲了解決這個問題,我們使用正常模式分析將〜800個比較模型的動

原创 藥物設計中的馬爾可夫狀態模型

MSM是根據分子動力學(MD)的時間序列構建的,該時間序列可以通過經典的MD模擬生成。MSM的幾個功能可用於合理的藥物設計。經過驗證的MSM的離散化特別適合從構象集合中提取有意義的代表,因爲離散化會產生少量的微狀態並反映自由能態的

原创 對N‐BK7®的氟基反應等離子體射流加工進行溫度處理的有效性的研究

在這項研究中,對基於氟的反應等離子體射流進行了研究,將其作爲N-BK7®超精密表面加工的有前途的工具。等離子體生成的粒子與N-BK7表面反應生成揮發性和非揮發性化合物。揮發性化合物的解吸導致蝕刻的表面,而非揮發性化合物在蝕刻區域形

原创 一些計算軟件介紹

ABINIT http://www.abinit.org/ ABINIT的主程序使用贗勢和平面波, 用密度泛函理論計算總能量, 電荷密度, 分子和週期性固體的電子結構, 進行幾何優化和分子動力學模擬, 用TDDFT(對分子)或G

原创 VASP 結構優化、靜態自洽、非自洽計算

第一步:結構優化(遲豫) 結構優化也叫結構遲豫。是指對整個輸入體系的座標進行調整,得到一個相對穩定的基態結構。結構優化分原子遲豫和電子迭代兩個嵌套的過程,每次計算中都進行原子遲豫和電子迭代計算(電子迭代嵌套在原子遲豫中),達到原子

原创 β-磷酸三鈣複合材料在骨科中的應用現狀

目前,生物陶瓷材料已廣泛用於脊柱外科手術中作爲骨移植物。但是,生物陶瓷材料存在一些侷限性。硫酸鈣在體內迅速吸收,其降解通常發生在新骨骼形成之前。羥基磷灰石(HA)幾乎不被吸收,從而阻礙了新骨骼的形成和重塑,並導致較差的局部穩定性或

原创 雙吲哚取代基的位置與化學組成之間的關係決定了它們與G-四鏈體DNA的相互作用

G-四鏈體(G4)DNA結構與基本的生物過程和人類疾病相關,這觸發了影響這些DNA結構的化合物的發展。但是,需要更多有關小分子如何與G4 DNA結構相互作用的知識。這項研究描述了新型雙吲哚(3,3-二吲哚基甲基衍生物)的開發,並通

原创 SWISS-MODEL和Swiss-Pdb Viewer:用於比較蛋白質建模的環境

比較蛋白建模越來越受到關注,因爲它在誘變實驗的合理設計過程中提供了極大的幫助。但是,這種方法的可用性以及所產生的模型受到昂貴的計算機硬件和軟件的可用性的限制。爲了克服這些限制,我們開發了一種用於比較蛋白質建模的環境,該環境由SWI

原创 1,2,3-三唑連接的1,2,4-三嗪[5,6- b ]吲哚的點擊合成,抗菌活性和分子對接研究

1,2,3-三唑是一組有價值的五元氮雜環化合物,可以通過疊氮化物-炔烴環加成反應合成。它們在有機化學,藥物化學,藥物發現,農用化學品和染料中具有出色的應用。此外,這些化合物被證明具有涉及抗HIV,藥學性質的寬範圍抗微生物劑,和b

原创 先進的適體作爲癌症治療學應用的分子探針—分子動力學模擬的作用

Theranostics涵蓋了用於疾病診斷的細胞生物標記的新興技術以及將藥物成分定向引入特定惡性部位的技術。治療學的發展已成爲有效診斷和治療疾病尤其是癌症的重要生物醫學研究成果。用於治療療法應用的有效的生物標記和靶向遞送策略需要具

原创 具有Slater類型軌道的雙重混合DFT計算

在一個包含1,644個數據點的綜合數據庫中,涵蓋了主族以及過渡金屬化學的多個方面,我們評估了60個密度泛函近似(DFA)的性能,其中包括36個雙雜種(DH)。所有計算均使用具有三重ζ(TZ)質量的Slater類型軌道(STO)基集

原创 分子動力學對非晶-多晶纖維素的熱物理性質

對於化工廠和製藥廠的工程和過程設計,熱物理性質的知識至關重要。 這裏,玻璃化轉變溫度(Ť 克),熱容量(曲線Ç p),各向同性熱膨脹係數(α p)和等溫壓縮(β Ť)計算爲無定形/次晶(AM-PAR)在纖維素的結構藉助CHARMM

原创 單層厚SrRuO中的拓撲霍爾效應3缺陷工程誘發的分層

拓撲霍爾效應是在超薄SrRuO中發現的3(SRO)膜,其中SRO層和另一個氧化物層之間的界面破壞了反轉對稱性,導致了薄膜的出現。因此,這種現象只出現在幾個單元電池的超薄SRO薄膜中。除了採用異質結構之外,在體SRO中,反型對稱性可