按照國家有關規定，從事涉及國家祕密的計算機信息系統集成業務的單位，須經保密工作部門審批，並取得《涉及國家祕密的計算機信息系統集成資質證書》，方可從事涉密信息系統集成業務。
爲進一步加強對涉及國家祕密的計算機信息系統的規範化管理，確保國家祕密信息的安全，國家保密局修訂下發了新的管理辦法。原頒發的資質證書有效期截止到2005年9月30日，從2005年10月1日起啓用新的資質證書。根據新的管理辦法規定，涉密系統集成資質分爲甲級、乙級和單項三種，並引入了評估機制。
涉及國家祕密的計算機信息系統集成資質的種類與限定如下：
涉密系統集成資質分爲甲級、乙級和單項三種資質。
涉密系統集成資質分爲甲級、乙級和單項三種資質。
A、甲級資質單位可在全國範圍內承接涉密信息系統的規劃、設計和實施業務，並僅可承擔本單位承建的涉密信息系統的系統服務和系統諮詢工作，不得從事其它單項資質業務。
B、乙級資質單位僅限在所批准的省、自治區、直轄市所轄行政區域內承接涉密信息系統的規劃、設計和實施業務，並僅可承擔本單位承建的涉密信息系統的系統服務和系統諮詢工作，不得從事其它單項資質業務。
C、單項資質單位可在全國範圍內開展業務，但僅限承接所批准的涉密系統集成單項業務，如：軟件開發、綜合佈線、系統服務、系統諮詢、屏蔽室建設、風險評估、工程監理、數據恢復等。
取得甲級或乙級資質的單位如需承接單項業務，必須申請並取得相應的單項資質。取得某一單項資質的單位如需從事其它單項業務，必須申請相應的單項資質。
單項資質包括：風險評估、工程監理、屏蔽室建設、軟件開發、數據恢復、系統諮詢、系統服務、綜合佈線、軍工。