五大單元中最重要的控制、算術邏輯被整合到 CPU 的封裝中，系統單元，存儲單元，輸入、輸出單元。
CPU 其實內部已經含有一些微指令，我們所使用的軟件都要經過 CPU 內部的微指令集來達成才行。指令集主要分爲兩種，兩種設計理念，常用的兩種CPU架構精簡指令集 (RISC) 與 複雜指令集 (CISC) 系統。
精簡指令集 (Reduced Instruction Set Computer, RISC):
精簡指令集(RISC)比較精簡，所有指令的格式都是一致的，所有指令的指令週期也是相同的，並且採用流水線技術。每個指令處理時間都比較短，性能較好。處理複雜事件需要多個指令完成。很多手機，導航系統，交換機，路由器大多使用的是ARM架構的CPU。
精簡指令集，是計算機中央處理器的一種設計模式，也被稱爲RISC(Reduced Instruction Set Computing的縮寫)。 [1] 這種設計思路對指令數目和尋址方式都做了精簡，使其實現更容易，指令並行執行程度更好，編譯器的效率更高。常用的精簡指令集微處理器包括DECAlpha、ARC、ARM、AVR、MIPS、PA-RISC、PowerArchitecture(包括PowerPC)和SPARC等。這種設計思路最早的產生緣於有人發現，儘管傳統處理器設計了許多特性讓代碼編寫更加便捷，但這些複雜特性需要幾個指令週期才能實現，並且常常不被運行程序所採用。此外，處理器和主內存之間運行速度的差別也變得越來越大。在這些因素促使下，出現了一系列新技術，使處理器的指令得以流水執行，同時降低處理器訪問內存的次數。早期，這種指令集的特點是指令數目少，每條指令都採用標準字長、執行時間短、中央處理器的實現細節對於機器級程序是可見的（本段來源百度百科）。
複雜指令集(Complex Instruction Set Computer, CISC):
複雜指令集(CISC)與RISC不同的，CISC在微指令集的每個小指令可以執行一些較低階的硬件操作，指令數目多而且複雜， 每條指令的長度 並不相同。指令執行較爲複雜所以處理時間上較長，但是處理的事件比較豐富。比如AMD、inter的x86架構CPU。
CISC是臺式計算機系統的基本處理部件，每個微處理器的核心是運行指令的電路。指令由完成任務的多個步驟所組成，把數值傳送進寄存器或進行相加運算。CISC是一種執行整套計算機指令的微處理器，起源於80 年代的MIPS主機（即RISC 機），RISC機中採用的微處理器統稱RISC處理器。這樣一來，它能夠以更快的速度執行操作（每秒執行更多百萬條指令，即MIPS）。因爲計算機執行每個指令類型都需要額外的晶體管和電路元件，計算機指令集越大就會使微處理器更復雜，執行操作也會更慢（本段來源百度百科）。