一、使用spm中的wfupickatlas工具
該工具裏有很多腦模板,選取ROI可以在裏面選擇後保存爲mask。這個方法是在標準模板(MNI)下直接標記而做的,這裏把wfupickatlas工具包【提取碼:a6bi】放進來吧。
使用方法:
將壓縮包解壓後放入到spm路徑下的toolbox目錄裏,然後在MATLAB中添加路徑即可。然後在spm裏的toolbox下選擇wfupickatlas選擇你要定義的ROI就行了。
二、使用fsl對單個被試分割
fsl裏面分割roi的方法大概有fslmaths、first、fsleyes這三種方法,具體方法YouTube上都有就不詳細說了。
三、使用MarsBar進行定義ROI
MarsBar工具包之前的文章裏有,MarsBar與spm的wfupickatlas還是有一些區別的,這裏說下主要的區別吧,MarsBar不僅可以定義sphere,box,還能設置box的設置方法。比如根據xyz的座標範圍來定(對之後殼核的分割方法有用)。