nii格式和mat格式轉化(只針對功能磁共振成像)

mat格式與nii格式的ROI轉化

問題描述:

我是在對殼核分割的時候出現的這個問題,因爲我要用分割出來的殼核或者是從wfupickatlas中定義的ROI來和自己設置的ROI來進行combine取交集。這時就出現了一個問題,前面定義的出來的格式是nii格式的,而用MarsBar定義的ROI是mat格式的,並且MarsBar只能識別mat格式的roi。於是上網查兩者的格式如何轉化,也有好多方法來實現互相轉化,這裏就不說了,因爲並沒有解決我的這個問題,我將nii轉換爲mat後MarsBar並不能識別。困惑了好久,才發現MarsBar本身就可以實現。。。。(有點尷尬)

具體方法:

方法其實很簡單,MarsBar界面有個ROI definition,這個選項下面就有Import/Export兩個按鈕(之前一直沒管過是幹什麼的,以後還是得多注意),直接演示吧。

nii轉mat

因爲MarsBar是mat格式的,因此選擇Import導入按鈕來進行轉化:

點擊Import,如下:
在這裏插入圖片描述
選擇cluster image,點擊:
在這裏插入圖片描述
然後,選擇nii格式的圖片,done
在這裏插入圖片描述
選擇輸出路徑,然後Done,如下:
在這裏插入圖片描述
其他的默認就行
在這裏插入圖片描述
之後就轉化成功了,如下,這裏之所以是兩個mat是因爲Putamen是經過左右合併後的:
在這裏插入圖片描述
之後就可以選擇view來查看了:
在這裏插入圖片描述
在這裏插入圖片描述

mat轉nii

這裏使用Export選項,操作如下:
在這裏插入圖片描述
點擊cluster image,如下:
在這裏插入圖片描述
選擇mat文件,done,如下:
在這裏插入圖片描述
選擇輸出文件:
在這裏插入圖片描述
文件名設置如下,回車即可。
在這裏插入圖片描述
nii結果如下:
在這裏插入圖片描述

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