升級qiime2

# 安裝miniconda軟件管理器:用於安裝QIIME2及依賴關係 https://conda.io/miniconda.html
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 
# 按提示操作,如回車確定,輸入yes同意許可,輸入安裝目錄或回車按默認安裝;
# 完成後關閉當前終端,新打開一個終端繼續操作才能生效
# 升級conda爲最新版:新版的bug最少,碰到問題的機會也小
conda update conda
# 安裝qiime2-2017.7,下載安裝所有依賴關係,網速不沒,時間差別很大,我安裝大約半小時
conda create -n qiime2-2017.7 --file https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2017.7-conda-linux-64.txt
# 激活工作環境,需要幾十秒
source activate qiime2-2017.7
# 檢查是否安裝成功,彈出程序幫助即成功
qiime --help
# 關閉工作環境:不用時關閉,不然你其它程序可能會出錯
source deactivate

 

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