升级qiime2

# 安装miniconda软件管理器:用于安装QIIME2及依赖关系 https://conda.io/miniconda.html
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 
# 按提示操作,如回车确定,输入yes同意许可,输入安装目录或回车按默认安装;
# 完成后关闭当前终端,新打开一个终端继续操作才能生效
# 升级conda为最新版:新版的bug最少,碰到问题的机会也小
conda update conda
# 安装qiime2-2017.7,下载安装所有依赖关系,网速不没,时间差别很大,我安装大约半小时
conda create -n qiime2-2017.7 --file https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2017.7-conda-linux-64.txt
# 激活工作环境,需要几十秒
source activate qiime2-2017.7
# 检查是否安装成功,弹出程序帮助即成功
qiime --help
# 关闭工作环境:不用时关闭,不然你其它程序可能会出错
source deactivate

 

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