- ISAM：ISAM是一個定義明確且歷經時間考驗的數據表格管理方法，它在設計之時就考慮到數據庫被查詢的次數要遠大於更新的次數。因此，ISAM執行讀取操作的速度很快，而且不佔用大量的內存和存儲資源。ISAM的兩個主要不足之處在於，它不支持事務處理，也不能夠容錯：如果你的硬盤崩潰了，那麼數據文件就無法恢復了。如果你正在把ISAM用在關鍵任務應用程序裏，那就必須經常備份你所有的實時數據，通過其複製特性，MYSQL能夠支持這樣的備份應用程序。
- MyISAM：MyISAM是MySQL的ISAM擴展格式和缺省的數據庫引擎。除了提供ISAM裏所沒有的索引和字段管理的大量功能，MyISAM還使用一種表格鎖定的機制，來優化多個併發的讀寫操作，其代價是你需要經常運行OPTIMIZE
TABLE命令，來恢復被更新機制所浪費的空間。MyISAM還有一些有用的擴展，例如用來修復數據庫文件的MyISAMCHK工具和用來恢復浪費空間的
MyISAMPACK工具。MYISAM強調了快速讀取操作，這可能就是爲什麼MySQL受到了WEB開發如此青睞的主要原因：在WEB開發中你所進行的大量數據操作都是讀取操作。所以，大多數虛擬主機提供商和INTERNET平臺提供商只允許使用MYISAM格式。MyISAM格式的一個重要缺陷就是不能在表損壞後恢復數據。 - InnoDB：InnoDB數據庫引擎都是造就MySQL靈活性的技術的直接產品，這項技術就是MYSQL+API。在使用MYSQL的時候，你所面對的每一個挑戰幾乎都源於ISAM和MyISAM數據庫引擎不支持事務處理（transaction
process）也不支持外來鍵。儘管要比ISAM和
MyISAM引擎慢很多，但是InnoDB包括了對事務處理和外來鍵的支持，這兩點都是前兩個引擎所沒有的。如前所述，如果你的設計需要這些特性中的一者或者兩者，那你就要被迫使用後兩個引擎中的一個了。 - MEMORY: MEMORY是MySQL中一類特殊的存儲引擎。它使用存儲在內存中的內容來創建表，而且數據全部放在內存中。這些特性與前面的兩個很不同。每個基於MEMORY存儲引擎的表實際對應一個磁盤文件。該文件的文件名與表名相同，類型爲frm類型。該文件中只存儲表的結構。而其數據文件，都是存儲在內存中，這樣有利於數據的快速處理，提高整個表的效率。值得注意的是，服務器需要有足夠的內存來維持MEMORY存儲引擎的表的使用。如果不需要了，可以釋放內存，甚至刪除不需要的表。MEMORY默認使用哈希索引。速度比使用B型樹索引快。當然如果你想用B型樹索引，可以在創建索引時指定。注意，MEMORY用到的很少，因爲它是把數據存到內存中，如果內存出現異常就會影響數據。如果重啓或者關機，所有數據都會消失。因此，基於MEMORY的表的生命週期很短，一般是一次性的。
在實際工作中，選擇一個合適的存儲引擎是一個比較複雜的問題。每種存儲引擎都有自己的優缺點，不能籠統地說誰比誰好。
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InnoDB：支持事務處理，支持外鍵，支持崩潰修復能力和併發控制。如果需要對事務的完整性要求比較高（比如銀行），要求實現併發控制（比如售票），那選擇InnoDB有很大的優勢。如果需要頻繁的更新、刪除操作的數據庫，也可以選擇InnoDB，因爲支持事務的提交（commit）和回滾（rollback）。
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MyISAM：插入數據快，空間和內存使用比較低。如果表主要是用於插入新記錄和讀出記錄，那麼選擇MyISAM能實現處理高效率。如果應用的完整性、併發性要求比較低，也可以使用。
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MEMORY：所有的數據都在內存中，數據的處理速度快，但是安全性不高。如果需要很快的讀寫速度，對數據的安全性要求較低，可以選擇MEMOEY。它對錶的大小有要求，不能建立太大的表。所以，這類數據庫只使用在相對較小的數據庫表。
注意，同一個數據庫也可以使用多種存儲引擎的表。如果一個表要求比較高的事務處理，可以選擇InnoDB。這個數據庫中可以將查詢要求比較高的表選擇MyISAM存儲。如果該數據庫需要一個用於查詢的臨時表，可以選擇MEMORY存儲引擎。