Python優雅地可視化數據

最近看《機器學習系統設計》…前兩章。學到了一些用Matplotlib進行數據可視化的方法。在這裏整理一下。

聲明:由於本文的代碼大部分是參考書中的例子,所以不提供完整代碼,只提供示例片段,也就是隻能看出某一部分用法,感興趣的需要在自己的數據上學習測試。

最開始,當然還是要導入我們需要的包:

# -*- coding=utf-8 -*-
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
import numpy as np
import itertools

1. 畫散點圖

畫散點圖用plt.scatter(x,y)。畫連續曲線在下一個例子中可以看到,用到了plt.plot(x,y)

plt.xticks(loc,label)可以自定義x軸刻度的顯示,第一個參數表示的是第二個參數label顯示的位置loc。

plt.autoscale(tight=True)可以自動調整圖像顯示的最佳化比例 。

plt.scatter(x,y)
plt.title("Web traffic")
plt.xlabel("Time")
plt.ylabel("Hits/hour")
plt.xticks([w*7*24 for w in range(10)],['week %i' %w for w in range(10)])
plt.autoscale(tight=True)
plt.grid()
##plt.show()

畫出散點圖如下:

這裏寫圖片描述

2. 多項式擬合併畫出擬合曲線

## 多項式擬合
fp2 = np.polyfit(x,y,3)
f2 = np.poly1d(fp2)

fx = np.linspace(0,x[-1],1000)
plt.plot(fx,f2(fx),linewidth=4,color='g')
## f2.order: 函數的階數
plt.legend(["d=%i" % f2.order],loc="upper right")
plt.show()

效果圖:

這裏寫圖片描述

3. 畫多個子圖

這裏用到的是sklearn的iris_dataset(鳶尾花數據集)。

此數據集包含四列,分別是鳶尾花的四個特徵:

  • sepal length (cm)——花萼長度
  • sepal width (cm)——花萼寬度
  • petal length (cm)——花瓣長度
  • petal width (cm)——花瓣寬度

這裏首先對數據進行一定的處理,主要就是對特徵名稱進行兩兩排列組合,然後任兩個特徵一個一個做x軸另一個做y軸進行畫圖。

# -*- coding=utf-8 -*-
from matplotlib import pyplot as plt
from sklearn.datasets import load_iris
import numpy as np
import itertools

data = load_iris()
#print(data.data)
#print(data.feature_names)
#print(data.target)

features = data['data']
feature_names = data['feature_names']
target = data['target']
labels = data['target_names'][data['target']]

print(data.data)
print(data.feature_names)

這裏有一個排列組合參考代碼,最後是取出了兩兩組合的情況。

排列組合的結果是feature_names_2包含了排列組合的所有情況,它的每一個元素包含了一個排列組合的所有情況,比如第一個元素包含了所有單個元素排列組合的情況,第二個元素包含了所有的兩兩組合的情況……所以這裏取出了第二個元素,也就是所有的兩兩組合的情況

feature_names_2 = []
#排列組合
for i in range(1,len(feature_names)+1):
    iter = itertools.combinations(feature_names,i)
    feature_names_2.append(list(iter))

print(len(feature_names_2[1]))
for i in feature_names_2[1]:
    print(i)

下面是在for循環裏畫多個子圖的方法。對我來說,這裏需要學習的有不少。比如

  • for i,k in enumerate(feature_names_2[1]):這一句老是記不住。
  • 比如從列表中取出某元素所在的索引的方法:index1 = feature_names.index(k[0]),也即index = list.index(element)的形式。
  • 比如for循環中畫子圖的方法:plt.subplot(2,3,1+i)
  • 比如for循環的下面這用法:for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):
plt.figure(1)
for i,k in enumerate(feature_names_2[1]):
    index1 = feature_names.index(k[0])
    index2 = feature_names.index(k[1])
    plt.subplot(2,3,1+i)
    for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):        
        plt.scatter(features[target==t,index1],features[target==t,index2],marker=marker,c=c)
        plt.xlabel(k[0])
        plt.ylabel(k[1])
        plt.xticks([])
        plt.yticks([])
        plt.autoscale()
        plt.tight_layout()      
plt.show()

這裏的可視化效果如下:

這裏寫圖片描述

4. 畫水平線和垂直線

比如在上面最後一幅圖中,找到了一種方法可以把三種鳶尾花分出來,這是我們需要畫出模型(一條直線)。這個時候怎麼畫呢?

下面需要注意的就是plt.vlines(x,y_min,y_max)plt.hlines(y,x_min,x_max)的用法。

plt.figure(2)
for t,marker,c in zip(range(3),">ox","rgb"):        
    plt.scatter(features[target==t,3],features[target==t,2],marker=marker,c=c)
    plt.xlabel(feature_names[3])
    plt.ylabel(feature_names[2])
    # plt.xticks([])
    # plt.yticks([])
    plt.autoscale()    
plt.vlines(1.6, 0, 8, colors = "c",linewidth=4,linestyles = "dashed")
plt.hlines(2.5, 0, 2.5, colors = "y",linewidth=4,linestyles = "dashed")
plt.show()  

此時可視化效果如下:

這裏寫圖片描述

5. 動態畫圖

plt.ion()打開交互模式。plt.show()不再阻塞程序運行。

注意plt.axis()的用法。

plt.axis([0, 100, 0, 1])
plt.ion()

for i in range(100):
    y = np.random.random()
    plt.autoscale()
    plt.scatter(i, y)
    plt.pause(0.01)

可視化效果:

這裏寫圖片描述


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