最近重新安裝一遍CAMB，正好以自己的安裝過程來寫一個教程，希望對後來者有幫助
文章目錄
1 CAMB
1.1 CAMB安裝
參考githubCAMB
步驟如下：
- 1，使用命令
git clone --recursive https://github.com/cmbant/CAMB拷貝到自己需要安裝的目錄下（筆者在工作路徑下新建了一個名爲CAMB的目錄） - 2 ，進入下載的目錄下，使用命令
pip install -e . - 3 ， 使用命令
python setup.py make，這需要安裝gfortran，如果沒有安裝，可以通過sudo apt-get install gfortran來安裝，並通過gfortran --version查看是否安裝成功，如果顯示版本則成功。 - 4，完成上面兩步已經結束了安裝，現在測試，（注意python版本的camb已經將
camb作爲一個命令名，所以可以直接使用camb執行命令），測試代碼爲camb inifiles/planck_2018.ini，（這裏，由於輸出會產生大量文件，所以我新建了一個名爲test的目錄，在目錄裏面運行camb ../inifiles/planck_2018.ini）,如果正確產生下圖文件，則安裝成功
![在這裏插入圖片描述]()
另外值得一提的是，這個python版本的CAMB是可以使用python程序的，demo見python camb demo
1.2 CAMB簡單應用
1.2.1 使用CAMB畫功率譜
可以參考官網的readme-fortran文檔除了上面的1.1節提到的demo之外，這裏主要講fortran版本的例子。以前在網易博客上寫過一篇簡單應用的博文-使用CAMB畫功率譜。但是網易博客似乎倒閉了，所以圖片無法識別，這裏不打算再次重複上面說的博文的過程（博文沒有了圖片，但是大致是可以猜到說什麼的）。此時不需要再用./camb params.ini編譯，而是直接使用camb params.ini來編譯，因爲camb在python版中已經成爲一個命令。同樣，運行之後會生成很多文件，所以我是在test目錄下運行的。
2 CosmoMC
2.1 CosmoMC安裝
這個安裝之前要先安裝依賴的庫，過程很複雜，所幸有參考文獻，一下是四篇最主要的參考來源（主要參考前三篇）：
1， 星空下
2， Ming-Hua Li的論文
3，CosmoMC官網readme
4, planck_likelihood_CosmoMC_readme
這裏在上面的參考文獻上做補充：
- 1， 關於intel Fortran編譯器，網址爲intel software tool,這裏我直接選擇了student，因爲student是免費的，所以需要以學生郵箱和學校註冊驗證通過後纔會郵箱收到信息，然後下載這個軟件。註冊的過程爲：點擊intel@parallel studio XE下的linux(選擇符合自己的系統，筆者是linux)，然後全畫勾進入註冊界面
- 2，在文獻1中的第2部分，一定要注意文中所說的lapack的問題，安裝ifort的時候如果自己的電腦是64位，那麼在安裝的過程中要選擇64的選項。也就是安裝的過程中有選擇IA 32和64的時候選擇32（因爲它前面是x號，選擇表示去掉），安裝的時候會看到說找不到32表示已經選了64了。
- 3 文獻1中的第5部分：
./waf configure --lapack_mkl=${MKLROOT} --install_all_deps時，如果輸出結果找不到cfitsi,則要自己指定：如./waf configure --lapack_mkl=${MKLROOT} --install_all_deps --cfitsio_prefix=/home/username/software/cfitsi這裏cfitsi是自己安裝的cfitsi路徑（文獻1的作者已經做了修改），安裝他的提示可以完成。 - 4 文獻2中的F部分，plc （planck likelihood and Chains）(文獻1也提到plc-2,筆者用的3.01)參考planck似然，也可以直接下載COM_Likelihood_code（有3.0和3.01的版本），已經不需要像F中提到的那樣再進入plc中vi Makefile改內容，這部分直接參考文獻1即可。(下載的時候有一個技巧：點擊頁面框後面的鏈接按鈕，選擇wget，然後使用wget終端下載即可)
- 5 由於很多軟件已經更新，所以筆者使用的版本都比1和2文中提到的版本高
- 6 文獻1中提到的plc_2.0，這裏筆者使用COM_Likelihood_Data-baseline_3.0
安裝遇到的問題：
./cosmomc: relink ‘xxx/intel/compilers_and_xx/libirc.so’ with ‘/lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6’ for IFUNC symbol ‘memmove’
這個問題是由於plc-3.01沒有正確指定路徑造成的，可以重新裝一遍plc
Acknowledgements
花了兩天時間終於安裝完了,感謝文獻1中作者的幫助, 如有必要，再寫CosmoMC的使用
2.1 CosmoMC使用
**1）編譯 **
make all
(如果有改動要重新編譯可以使用make clean， make delete刪除編譯過的文件)
2） 修改test.ini文件，增加或註釋數據
使用planck15年的數據，註釋18年的數據
3）運行cosmoMC
mpirun -np 4 ./cosmomc test.ini 使用4個進程
4）查看結果
爲了防止產生的文件過多比較亂，在CosmoMC目錄下建一個名爲plot_data的文件夾，將disttest.ini文件中做如下修改：
運行：
./getdist disttest.ini
得到的文件包括如下
要畫二，三維圖使用python
python test_tri.py
python test_2D.py
也可以使用python來畫圖，指定輸出的參數----參考文獻arXiv:1808.05080第V部分
爲防止文件混亂，在CosmoMC下建立一個名爲pytest的文件夾，在文件夾下創建名爲disttest.py的文件，內容爲：
from getdist import plots, MCSamples
f=plots.getSubplotPlotter(chain_dir='../chains/',width_inch=12)
f.triangle_plot('test',['omegabh2','omegach2','H0','logA','ns'],filled=True,
legend_labels=['PlanckTT}'], legend_loc='upper right',
line_args=[{'lw':1, 'color':'darkblue'}], contour_colors=['darkgreen'])
f.export('mymodel_cmb_tri.pdf')
使用python運行即可得到參數限制情況
3 常見問題
3.1 mpirun detected that one or more processes exited with non-zero status, thus causing…
問題描述，使用了planck 18年的數據，clik鏈接的是18年的。在/cosmoMC/CosmoMC/data$路徑下ll click*查看到的是如下的鏈接
plc_3.0是planck likelihood code 2018
而我在test.ini將planck 的數據使用的是2015年的(即batch2的數據，注batch3是18年的)
此時導致鏈接出了問題。簡言之，使用了15年數據，卻鏈接的是18年code。
解決方法：鏈接15年code
打開batch2/lowl.ini，有如下描述：
即15年的code是用的鏈接名是clik，而18年使用的是clik_14.0，所以現在將plc_2.0鏈接到CosmoMC/data下，並命名爲click，命令如下
ln -s /home/username/xxx/data/plc_2.0/ CosmoMC/data/clik #這裏code要使用絕對路徑