Talairach空間、MNI空間、Native空間、Stereotaxic空間

Talairach空間、MNI空間、Native空間、Stereotaxic空間

        Native空間就是原始空間。圖像沒有做任何變換時就是在原始空間。在這個空間中圖像的維度、原點、voxel size等都是不同的,不同被試的圖像之間不具有可比性,計算出來的任何特徵都不能進行統計分析,或是用於機器學習。所以必須對所有被試的圖像進行配準標準化到同一個模板上,這樣所有被試的維度、原點、voxel size就一樣了。使用MNI標準模板,就表示把圖像轉換至MNI空間了。一般而言MNI模板是最常用的,研究的比較多。標準空間的圖像也是指MNI空間的圖像。Talairach空間和MNI空間的座標有對應的關係,很多軟件都提供這個功能,如Mricron、REST等。Talairach空間只要是爲了判別當前座標在什麼結構上,注意Talairach atlas and Talairach coordinates 就是Stereotaxic space.

        若要轉換MNI和Talarich,有以下方法:

 

MNI2tal

Alternatively, you can download the appropriate Matlab file:

另有一個程序可以考慮:

Talairach Client - Version 2.4.2

使用Matlab讀取MASK、ROI座標的時候,圖像的起始原點是以1開始。
譬如Talairach atlas 維度是141,172,110:
MRIcroN讀圖的時候有兩個座標,左下角的是Native Space座標,左上角的是圖像座標,
左上角 = 左下角+[71,103,43]

偏移值與圖像的維度密切相關。

參考:點擊打開鏈接

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