Microbiome
https://microbiomejournal.biomedcentral.com
Microbiome位於BioMed Central旗下開放獲取期刊，一審平均時間62天，接收平均122天，接收到出版平均19天。投稿難易程度爲偏難，一般至少2位評審人，主編爲Jacques Ravel和Elizabeth Wellington。影響因子創刊後首次即9.000，目前10.465。版面費爲£1870(英鎊)、或$2790（美元，近2萬人民幣）、或€2290（歐元）。目前新增兩本子姊妹刊《Animal Microbiome》，《Environmental Microbiome》也會有不錯的表現，值得關注(小編估計將來至少在6分以上)。
辦刊宗旨
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/about
Aims and scope
Microbiome (微生物組)雜誌的核心目的是聯合環境、農業和生物醫學領域進行微生物組研究的研究人員。
廣泛討論微生物羣落研究的主題，如微生物調查、生物信息學、宏組學方法和羣落/宿主相互作用模型等將被優先考慮出版。通過這一系列的文獻，Microbiome 希望將研究人員與微生物生態學中廣泛的分支學科的共同科學目標結合起來。
Microbiome 作者的附加說明
生物名稱：細菌名稱應根據美國微生物學會和細菌學雜誌的指南編寫。基本上，所有微生物類羣（界、門、類、目、科、屬、種和亞種）的名稱應在手稿和圖片中斜體顯示。不要將菌株名稱或數字傾斜。
開放獲取
Open access
Microbiome發表的所有文章是永久在線免費獲取，沒有訂閱和註冊的障礙。
發表文章的版權由作者所有。
文章處理費用(APC)
Article-processing charges
開放存取出版並非沒有成本。因此，Microbiome 對每篇接受發表的文章徵收 1870.00英鎊 / 2790.00美元 / 2290.00歐元的文章處理費，加上適用的增值稅(VAT)或地方稅。
如果相應作者的機構參與我們的開放存取會員計劃，則可能會涵蓋部分或全部出版費用（會員頁面上提供更多詳細信息）。我們經常免除低收入國家作者的費用。對於其他國家，文章處理費用減免或折扣是根據具體情況向資金不足的作者授予的。作者可以在提交過程中申請豁免或折扣。有關詳細信息，請參閱我們的文章處理費用頁面 https://www.biomedcentral.com/getpublished/article-processing-charges 。
BMC提供免費的開放獲取資金支持服務，幫助作者發現和申請文章處理費用資金。訪問我們的OA資金和政策支持頁面，查看我們爲APC提供資金的研究資助者和機構列表，並瞭解有關我們的電子郵件支持服務的更多信息。
會員：https://www.biomedcentral.com/about/institutional-support/membership
中國地區有5個單位已加入，包括：軍事醫學科學院、中國科學院、中國農科院、中國疾控中心、北科生物。以上單位投稿及接收後發表文章時請註明，可能文章處理費用會有一定優惠。
索引/收錄情況
Indexing services
BIOSIS
Current Contents
DOAJ
Embase
MEDLINE
PubMed
PubMed Central
Science Citations Index Expanded
同行評審政策
Peer-review policy
同行評審是用於在稿件發表之前評估其質量的系統。相關研究領域的獨立研究人員評估提交稿件的原創性、有效性和重要性，以幫助編輯確定稿件是否應在其期刊上發表。閱讀有關同行評審過程的更多信息詳見 https://www.biomedcentral.com/getpublished/peer-review-process 。
同行評審流程圖
由Jacques Ravel和Liz Wellington編輯，Microbiome由專家編輯委員會支持 http://microbiomejournal.biomedcentral.com/about/editorial-board 。國內的編委有上海交大的趙立平、香港大學的張彤、碳雲智能的王俊(網站還標着華大基因)等。
Microbiome運行一個封閉的同行評審系統。稿件最初由期刊的編輯團隊（編輯主編，高級編輯和副編輯）進行篩選，並將合適的稿件發送給至少兩位評審員以供考慮。將根據審稿人的建議做出決定，但最終決定權歸編輯團隊所有。
通過登錄提交系統，作者將能夠在同行評審過程的任何時刻檢查其稿件的進度。
引用Microbiome中的文章
Citing articles in Microbiome
Microbiome中的文章應與傳統期刊中的文章一樣引用。由於沒有打印文章，因此沒有頁碼; 相反，他們會得到一個唯一的文章編號。
文章引用遵循以下格式：
作者：標題. 雜誌名 [年]，[卷號]：[文章編號]。
Authors: Title. Microbiome [year], [volume number]:[article number].
e.g. Roberts LD, Hassall DG, Winegar DA, Haselden JN, Nicholls AW, Griffin JL: Increased hepatic oxidative metabolism distinguishes the action of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor delta from Peroxisome Proliferator-Activated Receptor gamma in the Ob/Ob mouse. Microbiome 2009, 1:115.
指的是該期刊第1卷的第115條。
上訴和投訴
Appeals and complaints
如果您希望就拒絕或投訴提出申訴，您應首先聯繫編輯，編輯將提供期刊投訴程序的詳細信息。對於無法通過編輯解決的投訴，作者應聯繫發佈者。
爲什麼要在Microbiome中發表您的文章
Why publish your article in Microbiome
較高的知名度
Microbiome的開放獲取政策允許最大限度地查看期刊上發表的文章，因爲它們可供廣大的全球受衆使用。
出版速度
Microbiome提供快速的出版時間表，同時保持嚴格的同行評審; 所有文章必須在線提交，同行評審完全以電子方式進行管理（文章以PDF格式分發，這是從提交的文件中自動生成的）。文章將在完全引用後以完全可瀏覽的網絡形式和格式化PDF格式發佈。
靈活性
Microbiome中的在線出版物爲您提供了發佈大型數據集，大量彩色插圖和動態圖片的機會，以可以由其他軟件包直接讀取的形式顯示數據，以便讀者可以自己操作數據，以及創建所有相關鏈接（例如，PubMed，序列和其他數據庫，以及其他文章）。
宣傳和新聞報道
發表在Microbiome上的文章包含在文章提醒和常規電子郵件更新中。有些可能會在Microbiome的頁面和BioMed Central主頁上突出顯示。
此外，可以通過向一般或科學出版社發佈的新聞稿宣傳在微生物組中發表的文章。這些活動增加了Microbiome發表的文章的曝光率和訪問次數。最近由BioMed Central出版的期刊新聞發佈的文章列表可在此處獲取。
版權
作爲發表在Microbiome上的文章的作者，您保留了文章的版權，您可以自由複製和傳播您的作品（有關詳細信息，請參閱BioMed Central許可協議）。
主編Jacques Ravel
https://www.medschool.umaryland.edu/profiles/Ravel-Jacques/
傑克斯•拉威爾（Jacques Ravel），現爲美國巴爾的摩市馬里蘭大學醫學院基因科學中心副主任(Associate Director, Institute for Genome Sciences)、微生物免疫學(Microbiology and Immunology)教授，美國國立衛生研究院性傳播疾病研究中心副主任。馬里蘭大學環境分子微生物學博士、約翰霍普金斯大學博士後從事微生物自然產物研究。
之前工作於羅克維爾市(Rockville，馬里蘭中部)的TIGR研究所(第一個測序細菌基因組的地方)當助理研究員，曾被選爲American Academy of Microbiology(2012-2015)，Blaise Pascal International Research Chair。同時是Microbiome主編、mBio副主編。郵箱：
[email protected]
教育和工作經歷
B.Sc., 1990, Biology and Chemistry, University of Nancy I, France
M.Sc., 1992, Microbiology, University of Nancy I, France
Ph.D., 1994-99, Microbial Ecology, University of Maryland at College Park (Dr. Russell Hill, advisor)
Post-doctoral fellow, 1999-2002, The Johns Hopkins University, Chemistry Department (Dr. Craig Townsend)
Assistant Investigator, 2002-2007, The Institute for Genomic Research (TIGR), Rockville, MD
Associate Professor, 2007-2012, Dept. Microbiology and Immunology, University of Maryland School of Medicine
Professor, 2012-present, Dept. Microbiology and Immunology, University of Maryland School of Medicine
Associate Director for Genomics, 2010-present, Institute for Genome Sciences, University of Maryland School of Medicine
代表性工作
Jacques Ravel教授目前已經發表文章177篇，其中包括Nature、Nature Biotechnology、Nature Chemical Biology、Science、Science Translational Medicine、Microbiome、PNAS、Annual Review of Microbiology等雜誌。
主要代表工作如下：
Bradford LL, Ravel J. 2016. The vaginal mycobiome: a poorly understood contributor to women’s health and diseases. Virulence. 2016 Sep 22:0.
Robinson CK, Brotman RM, Ravel J. Intricacies of assessing the human microbiome in epidemiologic studies. Annals of Epidemiology. 2016 26(5):311-21.
Ravel J, Brotman RM. 2016. Translating the vaginal microbiome: gaps and challenges. Genome Medicine. 8:35.
Smith SB, Ravel J. 2016. The vaginal microbiota, host defense and reproductive physiology. Journal of Physiology. DOI: 10.1113/JP271694.
Marchesi JR, Ravel J. 2015. The vocabulary of microbiome research: a proposal. Microbiome 3:31.
此文詳見公衆號推送《Microbiome：微生物組名詞定義》
Nunn KL, Wang Y-Y, Harit D, Humphrys MS, Ma B, Cone R, Ravel J, Lai SK. 2015 Enhanced Trapping of HIV-1 by Human Cervicovaginal Mucus Is Associated with Lactobacillus crispatus-Dominant Microbiota. mBio. 6(5):e01084-15
實驗室簡介
實驗室主頁，研究方向爲陰道微生物組在女性健康中的作用 http://ravel-lab.org/
研究方向有7個，介紹的比較詳細：
VAGINAL SYSTEMS BIOLOGY
VAGINAL MICROBIOME AND PRETERM BIRTH
VAGINAL PHAGE
EPSTI
MICROBIOME-PATHOGENS INTERACTIONS
SPECIATEIT: 16S RRNA GENE CLASSIFIER
YOUR PRIVATE BIOME
人員信息並不完整，很多人連照片都沒有。
發表文章很多，但只更新到2016年。
資源欄目有兩個關於其在科學轉化醫學陰道微生物組動態研究的視頻介紹 。
最後一項是微生物分析服務，提供16S/ITS，宏基因組，宏轉錄組分析。想發這個雜誌的，可以試試。
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寫在後面
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