劉小澤寫於2020.7.22
今天下午看完並寫完了最後一章。當然這不是結束，也許只是一個開始
吸引
這本書的名字叫：《Orchestrating Single-Cell Analysis with Bioconductor》
我在2019年10月就關注了，原因很簡單，當時對單細胞很感興趣，並且這還是Bioconductor團隊出品，想必一定是精品。爲了增加辨識度，我給這本書取了個名字：單細胞交響樂。因爲單細胞分析就像一個大樂團，需要各個流程的協同配合，在後面的數據結構和處理流程上更是體現了這一點。一環扣一環才能演奏美妙的樂章。
開始是抱着試試看的心情，從基礎部分學習。不過要說真正吸引住我的，還是它的數據結構那一章，帶我清楚地認識了更爲複雜的數據類型
中斷
我想大部分人接觸單細胞數據，應該都是藉助cellraner、seurat流程學習的，也因此容易形成一個思維定勢，說到scRNA，就想到seurat R包。這本書不一樣，它全篇都是基於自己的數據結構，主要的R包也是自己團隊開發的Scater、Scran包，並且用法和Seurat相差很大。
由於單細胞一直也只是一個愛好（即使到目前爲止也是如此），沒有相關的課題督促，對於後面的scater、scran學習使用就有點牴觸。心想：我爲什麼要花時間去學習兩個用途差不多的包呢？用最流行的不就得了？
於是慢慢的，這本書在我心裏的地位就下降了，感覺它只是介紹了另外兩個R包而已，後來也不再有熱情去理解翻譯這本書了。
不捨
在放棄更新的一段時間，也感覺到不捨，畢竟想到了開頭卻沒想到結尾。
每次看到別人分享這本書，我都會偷偷打開之前的交響樂文件夾，看看裏面的幾篇筆記，然後嘆一口氣，再把它關上。
這個過程，前後重複了兩三遍，期間會想，等我有時間了，一定要補上後面的。這一等，就是大半年...
重拾
從6.23到7.22，經歷了剛好一個月，沒想到這一次我完成了這個長久的小心願。
2020年的6月，我去機場提早了5個小時。閒來無事，又想起了這本書，於是喜憂參半地再次打開網頁看看作者的更新進度。沒想到這一看，就該登機了。不過，這一次，我告訴自己，一定要完成之前沒有演奏完的交響樂。
藉着公衆號推出的專輯功能，我嘗試每寫一篇都發表然後放在專輯中，當做對自己的一個提醒。第一篇發表於2020-06-23，接下來的幾天，我都保持了每天閱讀一章、重複一遍、更新一篇的節奏，一般都是要保證半天以上的注意力集中。
後來的速度，就感覺慢慢加快了，因爲對整體的數據結構以及R包、函數的瞭解越來越深入，我也能明白作者想要做什麼事，又是如何去實現的。當然這必須要感謝Bioconductor團隊精心準備了各種測試數據集和詳細的操作代碼。
我打算最近將全部的學習筆記上線爲一本開源的書，我會再次對每章的內容進行審覈。既然是個人學習筆記，就不可能保證沒有錯誤。開源書的好處不就是有錯及時改，有更新及時加麼？
後面我還會添加更多的相關知識，而且保持與原書內容同步，但《單細胞交響樂》並不是原書的簡單翻譯版，其中會加入很多我自己的理解和補充。
最後
爲了表達對作者的敬意，在翻譯版本上線前，特意向Aaron徵求了意見
技術一直在進步，學習也從未停止。這本書也許沒有完結篇，只有未完待續~
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