1898年9月5日，光緒下詔授給譚嗣同和林旭、劉光第、楊銳四品卿銜軍機章京，參與維新變法。
1898年9月21日，慈禧發動政變，連發諭旨，捉拿維新派。9月24日，譚嗣同被捕；9月28日，譚嗣同、林旭、劉光第、楊銳、楊深秀、康廣仁被殺。
譚嗣同等4人只是被光緒安排了個四品小官，上任半個月就被慈禧下令抓捕，23天就被殺頭。慈禧爲什麼這麼着急。主要是因爲他們四個人被安排在了軍機處，而軍機處是清代處理全國軍政大事的常設核心機構，凌駕於內閣之上的國家真正的政務中心。
雍正七年（1729），清廷對西北準噶爾用兵，爲方便皇帝隨時召見大臣研究軍政大事並能保守軍事機密，在隆宗門內設置“軍機房”，作爲臨時軍事指揮機構。雍正十年（1732）軍機房正式改稱“辦理軍機處”，簡稱“軍機處”。直到宣統三年（1911），責任內閣成立後，軍機處才被撤銷。軍機處也是清代最重要、存在時間最長的中央最高輔弼機構。
軍機處的具體職掌主要是：撰擬諭旨和處理奏摺；議大政，議後提出處理意見，奏報皇帝裁奪；讞大獄，參與重大案件審擬；參與對重要官員的任免和考覈；隨侍皇帝出巡，奉旨出京查辦事件等。權力所及，均系朝廷軍政大事。
軍機處任職者無定員，最多時6、7人，由親王、大學士、尚書、侍郎或京堂充任。設首席軍機大臣，或稱領班軍機大臣，通稱大軍機，一般由滿族親王或大學士擔任。首任領班軍機大臣是爲雍正在九子奪嫡中勝出立下汗馬功勞的十三阿哥允祥；最後一位領班軍機大臣是慶親王愛新覺羅·奕劻。中間出任過這一職務的還有張廷玉、傅恆、劉統勳、阿桂、和珅、穆鄣阿、榮祿等共36人次。
其餘任職者按資歷地位、官品高低及在軍機處任職先後分別爲軍機大臣、軍機處行走、軍機處學習行走、軍機大臣上學習行走等。其僚屬稱軍機章京，協助軍機大臣處理文書檔案，票擬一般章奏，通稱小軍機。軍機大臣須每天值班，等候皇帝隨時召見。當天必須處理完畢每天由下面送達的奏章，以保證軍機處處理政務的極高效率。
譚嗣同等4人的職務雖說只是軍機章京，是軍機大臣的祕書，不可能也不應該能有機會接觸到皇帝。可光緒在任命他們的第二天就直接召見了他們，並對他們說：“汝等所欲變者，俱可隨意奏來，我必依從。即有我過失，汝等當面責我，我必速改。”
光緒將慈禧太后任命的軍機大臣晾在一邊，而直接和自己任命的軍機章京議事，就等於把慈禧太后晾在了一邊，慈禧怎能不急。她不能眼看着“好兒子”被譚嗣同帶壞了，於是匆忙出手，當機立斷，抓捕譚嗣同等人，不等審訊就急急地殺掉了。
位於故宮乾清門西側的軍機處，只是一排小房，在故宮衆多房宇中，極其普通，正像譚嗣同他們在清朝官員中的地位一樣。而軍機處在清朝歷史的作用，也和譚嗣同他們在維新變法中的作用一樣。
也許是譚嗣同他們與軍機處有太多的相似之似吧，參觀故宮博物院軍機處時，我纔會不由自主地想起了譚嗣同。