德雷克的遠征也得到了伊麗莎白一世女王的支持，雖然表面上此行目的是與南太平洋居民簽訂貿易條約，探索南半球傳說中的新大陸，但女王還授予了德雷克劫掠西班牙的船隻和港口，以及他們船隊財物的權利。女王告訴德雷克“打擊西班牙國王，爲我受的各種損失報仇，我會非常高興”正因爲有着這些不能言明的目的，這次遠征一開始就籠罩在神祕氣氛之中。船員直到英國的海岸線消失在遠方，才知道自己的目的地。
船隊一共五艘船，沒有一艘長度超過兩輛倫敦巴士。他們按照麥哲倫的航線作爲藍本，在同樣的海港補充給養，但有時停靠地並不能按計劃進行。在巴塔哥尼亞他們遭到了埋伏，直到德雷克拿了槍對着土著開了火才解決問題。然而沒過幾天手下又有人叛變被他處決。在許多不愉快的插曲結束後，船隊成功的從大西洋穿過了風高浪急的海峽進入太平洋。不過其中一艘較小的船已經掉隊。
他們又在海上整整漂了68天才看到了那片樹林繁茂的香料島。就在德雷克打算在蒂多雷火山島下錨時，旁邊的德拉蒂島總督划着獨木舟到了他的船邊，他說帝多雷島被可惡的葡萄牙人控制着，懇求這位英國指揮官能夠改變航程。德雷克挑選了一件精美的天鵝絨斗篷送給國王，並且說明要到此地購買香料。信使進很快帶來回復說國王願意將全島的商品和貿易都用於兩國交往。
國王最後還造訪了他們的船，德雷克和他的手下受到了難以置信的富有東方特色的款待。英國船員最初在東方人謙卑有禮面前不知所措，最終他們還是選用傳統方式慶祝這一時刻。船員把大炮裝滿了火藥，在洪亮的口令聲以及小號和樂聲中發射。慶祝完畢，國王准許他們在島上購買需要的任何香料。爲了減輕負重，船長下令把八門大炮全部扔進水中，還扔了許多穀物和豆類，最後扔掉了三噸寶貴的丁香，滿載而歸踏上返回英格蘭的漫長旅途。
德雷克的迴歸如同英雄般凱旋，他的那艘船上不僅有馥郁芬芳的香料，還有大量從西班牙和葡萄牙船上掠奪來的金銀財寶。船到普利茅斯，城中的男女老少都來一睹英雄的風采。伊麗莎白女王本人還親自在德福特德登船，將勇敢的領袖封爲騎士。德雷克回來不久，就有大量的歌謠，十四行詩，頌歌開始傳唱，紀念他的歷史性航程。
這次遠航也激發了伊麗莎白時代英格蘭人的想象力，他們更加堅定東方是一片神話般豐饒的土地。可惜德雷克這一路大部分財富都是掠奪而來，所以沒有記錄太多關於東方市場的信息，更沒有留下關於香料交易價格的細節。爲了更好發展香料貿易，商人們要放棄慣用海盜行徑的德雷克，開始另覓他人作爲指揮官。