原创 上海巴斯德所在新型冠狀病毒早期進化機制方面取得進展

中國科學院上海巴斯德研究所、中科院生物安全大科學中心上海分部崔傑研究組成員魏小曼、李祥等根據目前發表的新型冠狀病毒(2019-nCoV)分析結果及公共數據庫裏上傳的基因組比對結果,進行綜合分析,推測出此次暴發的新型冠狀病毒的早期進化機制

原创 Nature子刊:快速準確的微生物來源追溯工具FEAST

FEAST: 快速準確的微生物來源追溯工具FEAST: 快速期望最大化的微生物來源追溯FEAST: fast expectation-maximization for microbial source trackingNature Me

原创 全網最簡單的網絡圖畫法,小白福音包學包會

全網最簡單的網絡圖畫法,小白福音包學包會徐銳(助理研究員),廣東省生態環境技術研究所,土壤微生物與宏基因組方向版本1.0.1,更新日期:2020年6月23日本項目永久地址:https://github.com/YongxinLiu/Mi

原创 Nature子刊:Knight組發佈快速UniFrac算法

Striped UniFrac微生物組大尺度分析算法Striped UniFrac: enabling microbiome analysis at unprecedented scaleNature Methods, [IF 26.9

原创 宏基因組/微生物組雜誌簡介及2020最新影響因子

2020年6月29日,2019年度的影響因子發佈了,各種影響因子彙總的文章瞬間刷爆了朋友圈。作爲本領域的專業公衆號,每年都會藉此機會系統介紹一下本領域的雜誌,爲同行文獻閱讀、文章投稿的雜誌選擇、以及畢業升職加薪助力。祝大家2020都能實

原创 環境&微生物期刊—FEMS Microbiology Ecology

期刊快覽影響因子:IF=4.089,JCR2區官方主頁:https://academic.oup.com/femsec雜誌主編:Max Haggblom綜合評價:口碑不錯、評分4.5分個人評價(感謝廣東省生態環境技術研究所孫蔚旻老師及主

原创 246.三元圖的應用與繪圖實戰

三元圖在微生物組研究中的應用本節作者:吳一磊,中科院微生物所版本1.0.5,更新日期:2020年6月28日本項目永久地址:https://github.com/YongxinLiu/MicrobiomeStatPlot ,本節目錄 24

原创 223.主成分分析PCA

主成分分析 PCA本節作者:劉華,中國科學技術大學版本1.0.3,更新日期:2020年6月18日什麼是PCA(Principal Component Analysis)相關背景在許多領域的研究與應用中,通常需要對含有多個變量的數據進行觀

原创 知乎高贊:碩博生、留學生都在關注的幾個公衆號

導讀:學習如逆水行舟,不進則退;只有堅持不斷的學習,才能保持進步。今天給大家精心挑選的這幾個優質的公衆號,感興趣的可以關注。我要考編制長按二維碼【識別圖中二維碼】關注推薦理由 :我要考編制是做優質公務員與事業單位招考機會監控的。現在就業

原创 教你高效地學習和製作PPT

作爲一名學術人士,在埋首文獻、實驗之餘,向他人清晰闡述自己的研究內容也同等重要。學術成果彙報,參加國內外研究會議,甚至是求職,一場高質量的報告能更好的展示自己的工作成果。做報告本身也是一個幫助你係統分析自身科研進展、串聯研究思路的過程。

原创 方差分解分析 (VPA):定量不同環境因子對羣落變化的解釋比例

什麼是VPAVPA,全稱Variance Partitioning Analysis,中文成爲方差分解分析,該分析的目的是確定指定的環境因子對羣落結構變化的解釋比例。我們使用CCA/RDA的排序分析方法可以得到所有參與分析的環境因子對羣

原创 你想要的宏基因組-微生物組知識全在這(2020.7)

歡迎點擊上方藍色”宏基因組”關注我們!宏基因組/微生物組是當今世界科研最熱門的研究領域之一,爲加強宏基因組學技術和成果交流傳播,推動全球華人微生物組領域發展,中科院青年科研人員創立“宏基因組”公衆號,聯合海內外同行共同打造本領域純乾貨技

原创 Sciences:Knight組發表屍體降解過程中的微生物組

Metcalf, J. L., et al. (2016). “Microbial community assembly and metabolic function during mammalian corpse decomposit

原创 宏基因組合種華山松、雲杉專車3天領證

很多朋友都在支付寶裏面玩過螞蟻森林,爲大家支持中國綠化公益事業的行動點贊。有沒有羨慕小夥伴滿滿的植樹證書,也希望自己爲綠化做貢獻,但又感覺自己的力量太渺小。現在機會來了,宏基因組公衆號發起的合種樹活動,集合大家的力量,自2019年8月份

原创 EI:南土所褚海燕組發現農業土壤微生物核心菌羣能夠提升土壤生態功能

農業土壤微生物核心菌羣能夠提升土壤生態功能Abundance of kinless hubs within soil microbial networks are associated with high functional pote