原创 環境&微生物期刊—Applied and Environmental Microbiology

期刊快覽影響因子:IF=4.016,JCR 1區官方主頁:http://aem.asm.org/雜誌主編:Harold L. Drake,德國Universität Bayreuth 綜合評價:難度較大、口碑佳、審稿快、綜合評分5分個人

原创 Science:基於微生物條形碼系統的高分辨率物源追蹤技術

文章標題:Barcoded microbial system for high-resolution object provenance發表期刊:Science發表時間:2020.6第一作者:Qian Jason;Zhi-xiang L

原创 Microbiome:使用16S rRNA基因數據集實現種水平的分類

編譯:A國民少女,編輯:小菌菌、江舜堯。導讀16S rRNA基因測序的低成本促進了人口規模的分子流行病學研究。現有的計算算法可以將16S rRNA基因序列解析爲高分辨率擴增子序列變體(ASV),這代表了可用於不同研究的一致標籤。將這些A

原创 Microbiome:首個地球微生物“社會關係”網絡在浙大繪製!

      單個微生物看不見、摸不着,但卻無時不在、無處不在。但微生物的功能絕非“分解者”這麼簡單,影響到溫室氣體的、綠色生產的、人體健康的方方面面,其羣落組成和功能具有極高的複雜性。如何更好認識微生物的特性,過去科研人員常常在微觀尺度

原创 Cell子刊:微生物來源的細菌素靶向宿主抗早期斷奶仔豬腹瀉研究

微生物來源的細菌素靶向宿主抗早期斷奶仔豬腹瀉研究導讀    仔豬的早期斷奶可以縮短豬的屠宰週期並改善母豬的繁殖性能,然而早期斷奶容易導致應激性腹瀉,仔豬死亡率上升,生長性能降低。使用抗生素可以預防仔豬斷奶腹瀉,但由於病原菌抗生素抗性和抗

原创 Microbiome雜誌和主編介紹

Microbiomehttps://microbiomejournal.biomedcentral.comMicrobiome位於BioMed Central旗下開放獲取期刊,一審平均時間62天,接收平均122天,接收到出版平均19天。

原创 ISME:沈農欒軍波組揭示水平轉移基因的功能

DOI: https://doi.org/10.1038/s41396-020-0704-56月22日,瀋陽農業大學植物保護學院博士研究生任飛榮和孫想以共同第一作者身份在The ISME Journal上在線發表題爲Biotin pro

原创 合種樟子松/華山松專車3天領證

很多朋友都在支付寶裏面玩過螞蟻森林,爲大家支持中國綠化公益事業的行動點贊。有沒有羨慕小夥伴滿滿的植樹證書,也希望自己爲綠化做貢獻,但又感覺自己的力量太渺小。現在機會來了,宏基因組公衆號發起的合種樹活動,集合大家的力量,自2019年8月份

原创 你狠心沖掉的便便,正成爲許多腸胃病人的救星

新媒體管家 自從1928年抗生素被發現以來,人類就好比在對抗細菌上獲得了超級武器。遺憾的是,超級武器並沒有帶來全面的勝利。人類與細菌曠日持久的軍備競賽催生出了一批更加難纏的超級細菌。實際上,如果你在醫院注射抗生素的話,可能也會被它們盯上

原创 NAR:宏基因組網絡分析工具MetagenoNets

MetagenoNets:微生物相關網絡的綜合推斷和整合見解MetagenoNets: comprehensive inference and meta-insights for microbial correlation networ

原创 SCI-HUB文獻神器v7.0上線,免費下載99.9%國內外文獻!

簡介  說起免費文獻下載,SCI-HUB可以說是無人不曉了。不過SCI-HUB被判爲非法而被四處“追殺”,所以不得不經常更換域名,好不容易找到收藏的網址動不動就不能用了!今天小編推薦的1個SCI-HUB文獻下載神器,可幫助大家免費下載9

原创 QB:基於深度學習的病毒序列識別

    全球COVID-19新型冠狀病毒肺炎疫情使人們對病毒有了前所未有的關注。病毒不僅可以侵入人體等真核生物,還可以侵入細菌等原核生物。侵入細菌的病毒數量大約有1031,是地球上最豐富的生物體 [1]。病毒入侵細菌具有很強的特異性。通

原创 KOMODO:用16S rDNA序列預測其培養基配方的網站

本文轉載自“微生物生態”,己獲授權,本平臺編輯對內容進行測試和更新。今天盧瑟菌給大家隆重推出一個超級好的網站,網站名字叫KOMODO(Known Media Database),沒錯,網站作者就是嚴(tiao)肅(pi)地把科莫多巨蜥的

原创 字符串處理stringr包在微生物生態的應用基礎

使用stringr處理字符串正則表達式(regular expression,regexp)是處理字符串的核心步驟。正則表達式的用處非常大, 字符串通常包含的是非結構化或半結構化數據,正則表達式可以用簡練的語言來描述字符 串中的模式。s

原创 211.Alpha多樣性箱線圖(樣章,11圖2視頻)

《微生物組數據分析與可視化實戰》專著衆籌編寫《微生物組數據分析與可視化實戰》——成爲宏基因組學百科全書的創始人(目錄)編者序:初衷、計劃、要求、優勢、目標和展望本文爲樣章,211代表目錄中的第二章,第一節的第一部分,部分引用格式文字爲格