原创 Linux_常用命令耗時統計

cat 把一個大文件cat 在小文件的後面,200G差不多2小時

原创 Linux_掛起作業_qhold

Linux_掛起作業_qhold qstat 或者top一下,這個作業的job-ID,譬如是123456 然後qhold 123456 作業就掛起了 qrls 123456 作業就被釋放了

原创 Android開發_彈出小小提示框_Toast

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原创 生物信息_Call_snp_by_soapsnp_外顯子

生物信息_Call_snp_by_soapsnp_外顯子    數據: 人外顯子(5.6G左右,兩個gz文件,Agilent 50M,pe測序,90讀長) 方法:call_snp_by_soapsnp 每步估計需要投多大(僅作參考): S

原创 彈窗引發的用戶上帝說

        近日,牢騷小小白學習安卓開發,想好的界面一改再改,原本很簡單的東西又弄複雜了,就單單是個時間設置都弄了半天,一個大好晚上興致全無……         改變時間,彈窗,可以,但是偏偏不想,爲什麼顯示了時間的加減號了,還得彈窗

原创 Perl_哈希排序_sort

Perl_哈希排序_sort   對哈希的值排序 my %hash; $hash{"a"}=1; $hash{"b"}=2; $hash{"c"}=21; $hash{"d"}=4; $hash{"e"}=13; $hash{"f"}=1

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Linux_printf的格式聲明_百分號s_d   printf "get '%s,%s'\n" one two#get one two\nprintf "get '%s,%d,%s'\n" one 2 three#get one 2

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Linux_echo不打印最後的換行符_-n_轉義c   echo -n "string " echo "string \c"#string _ #string後面下劃線的地方可以繼續鍵入

原创 生物信息_SOAPalign_參數設置_例子

生物信息_SOAPalign_參數設置_例子   跑SOAPalign之前要建庫 /dir/2bwt-builder <sequence>注:會得到一堆的<sequence>.index文件,<sequence>.index指代建庫產生的

原创 Perl_標準輸入_STDIN

Perl_標準輸入_STDIN   #!usr/bin/perl -w use strict;my @a=<STDIN>;  #停止輸入的時候按ctrl+Dmy $out="/dir/out"; open OUT,">$out" || d

原创 Perl_傳入值or路徑or文件名等_@ARGV

Perl_傳入值or路徑or文件名等_@ARGV   die "usage: $0 [input1] [input2] [out]\n" unless (@ARGV == 3); open IN , "$ARGV[0]" || die "

原创 Perl_默認變量_$_and_@_

Perl_默認變量_$_and_@_   cat file1 A\t2\t7\tD B\t4\t2\tC D\t2\t4\tE   例 my $fil=/dir/file1; open IN, $fil || die "$!\n"; wh

原创 生物信息_SOAPsnp_參數設置_例子

生物信息_SOAPsnp_參數設置_例子   跑SOAPsnp: 例:/dir/SOAPsnp -i /dir/SOAP_output/pe.soap.sort -d /dir/ref_index/sequence1 -o /dir/S

原创 生物信息_Call_snp_by_soapsnp_全基因組

生物信息_Call_snp_by_soapsnp_全基因組   數據:人全基因組(100多G,兩個gz文件,已去接頭,pe測序,90讀長)方法:call_snp_by_soapsnp 每步估計需要投多大(僅作參考): Bwa(13G):

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    case control risk-> G a c   T b d   odds ratio=(a/b)/(c/d) Likelihood ratio=(a/(a+b))/(c/(