原创 高通量測序與雜交優勢
雜種優勢(hybrid vigor,heterosis) 雜種優勢一詞是1911年由Shall C H首先提出的，它一般都涉及數量性狀。雜種優勢有兩種概念：一種是認爲凡雜種的表現超過兩親本的平均值，就稱爲雜種優勢，超過越多，優勢越強；另一
2020-02-24 04:56:30
原创 序列拼接相關知識
一.依賴於參考序列的拼接，在進行對參考序列的比對時，有兩類區域reads不能很好的進行比對匹配： 1.原參考序列中存在未知的序列區域，主要爲scaffolds之間的連接區域和scaffolds內的gaps區域，多由富含重複序列或極端GC含
2020-02-24 04:56:30
原创 測序界的第一次
第一個被測序的全基因組：X174噬菌體 1977 第一個被測序的爬行動物基因組：北美綠色安樂蜥（Anolis carolinensis） 2011 第一個被測序的藻類基因組：超小型原始紅藻（Cyanidioschyzon merolae
2020-02-24 04:56:30
原创 轉錄組學研究
使用高通量測序技術對物種的轉錄組進行研究，具有以下優點： 1.靈敏度高，可以對痕量RNA進行檢測和定量； 2.可以獲得轉錄本全長，不但利於進行更準確的定量分析，而且可以發掘新轉錄本形式及插入/缺失突變； 3.適用於無參考序列物種，通過轉錄
2020-02-24 04:56:30
原创 基因組學的未解之謎
基因組學的未解之謎 隨着DNA測序技術的發展和廣泛應用，揭開了諸多令人困惑的“科學謎團”，同時也遇到了更復雜、更深刻、更具有挑戰性的新問題。 遺傳學和物種進化理論是生物學的幾大基石之一。DNA測序技術從根本上解決了發現遺傳變化的
2020-02-24 04:56:29
原创 BioPerl--SeqIO
Bio::SeqIO處理fasta和fastq文件 (2012-07-05 11:12:41) 轉載▼ 標籤： bioperl seqio 分類： Bioinformatics Bioperl裏提供的Bio
2018-08-25 15:00:46
原创 歐洲人淺色皮膚源自一萬年前一祖先基因突變
————————————————————————————————————————————————————— 愛美的妹紙，你的SLC24A5基因是什麼情況呀？歐洲人的SLC24A5基因在染色體15的比例上佔了約0.0072,非洲等地人
2018-08-25 15:00:45
原创 文章投稿必看
一、最初投稿Cover letterDear Editors:We would like to submit the enclosed manuscript entitled “Paper Title”, which we wish to
2018-08-25 15:00:44
原创 TALEN、ZFN以及CRISPR/Cas
新一代位點特異性基因組工程學利器——TALEN、ZFN以及CRISPR/Cas ... 2014-4-29 21:09| 發佈者: slytjiaofei| 查看: 95| 評論: 0|來自: 生物360 摘要: 前言 轉
2018-08-25 15:00:41
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原创 Tophat-fusion Manual
Manual Beginning users should take a look at the Getting started guide for a tutorial on running TopHat-Fusion. How
2018-08-25 15:00:40
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原创 DISCOVAR的使用說明
1. DISCOVAR簡介 DISCOVAR 是有 ALLPATHS-LG 軟件開發團隊做出來的軟件。主要用於利用 PE 250bp 數據與參考基因組的比對結果，對基因組進行 Variants calling 的同時，進行基因組的組裝。特
2018-08-25 15:00:39
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原创 Bisulfite Sequencing
全基因組重亞硫酸鹽測序（whole genome bisulfite sequencing）表觀遺傳學研究已經證實了特定基因區域的DNA甲基化修飾對於染色體構象、基因表達調控機制有着重要影響，而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學最爲
2018-08-25 15:00:39
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原创 測序幫--一個不錯的測序論壇
最近發現了一個做的不錯的測序論壇--測序幫，界面美觀，操作很方便。 各種功能也蠻新穎的，喜歡測序和分析的同學不如去看看，也許就是你喜歡的。 測序幫自己的簡介：測序幫，是一個專注於基因測序數據分析和解讀的社區，熱忱歡迎各位想了解測序行業第一
2018-08-25 15:00:39
原创 推薦一個文獻管理工具--Paperbox
向大家推薦一個文獻管理工具，paperbox，這款軟件有很多自己的特點，個人認爲最有用的就是它的文獻偵測功能，可以根據用戶提供的關鍵詞偵測最新發表的文章。 軟件下載地址：http://www.paper-box.co/?ref=haish
2018-08-25 15:00:39