使用高通量測序技術對物種的轉錄組進行研究，具有以下優點：
1.靈敏度高，可以對痕量RNA進行檢測和定量；
2.可以獲得轉錄本全長，不但利於進行更準確的定量分析，而且可以發掘新轉錄本形式及插入/缺失突變；
3.適用於無參考序列物種，通過轉錄組數據的組裝和拼接同樣可以進行定量和定性分析；
轉錄組學研究
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使用高通量測序技術對物種的轉錄組進行研究，具有以下優點：
1.靈敏度高，可以對痕量RNA進行檢測和定量；
2.可以獲得轉錄本全長，不但利於進行更準確的定量分析，而且可以發掘新轉錄本形式及插入/缺失突變；
3.適用於無參考序列物種，通過轉錄組數據的組裝和拼接同樣可以進行定量和定性分析；