原创 Bowtie2使用方法與參數詳細介紹
懶人必看Bowtie2 -q --phred33 --sensitive --end-to-end -I 0 -X 500 --fr --un unpaired --al aligned \--un-conc unconc --al-co
2020-06-30 02:55:59
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原创 vmware player開機時出錯：內部錯誤的解決辦法
vmware虛擬機開機時報錯：內部錯誤的解決辦法： 找到vmware player的exe位置，右鍵管理員啓動就可以了； 以管理員啓動後，可以和主系統交換文件：直接複製粘貼就Ok了。
2020-06-30 02:55:59
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原创 Fastx-toolkit installation on Ubuntu
Fastx-toolkit installation on Ubuntu ====================================
2020-06-30 02:55:59
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原创 英文簡歷中讚美自己的得體表達方式
Mature,dynamic and honest.思想成熟、精明能幹、爲人誠實。 Excellent ability of systematicalmanagement.有極強的系統管理能力。 Ability
2020-02-24 13:52:39
原创 Blast使用
簡介 Blast，全稱Basic Local Alignment Search Tool，即"基於局部比對算法的搜索工具"，由Altschul等人於
2020-02-24 13:52:39
原创 生物信息在線Manual網站
這是一個很不錯的Manuals網站，主要針對生物信息學的研究人員，裏面包括R、Bioconductor、NGS、EMBOSS、Linux等軟件和系統的使用教程。如： R Basics Manual BioConductor Manu
2020-02-24 13:52:39
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原创 BLAST2GO
記得在2年前用過blast2go，非常好用的序列註釋和分析工具。可是後來重新裝了幾次JAVA的新版本之後電腦裏的blast2go就掛了。最近重新把JAVA1.6裝了回來，忍不住又想到blast2go。打開熟悉的主頁上，猛擊此處： 接着
2020-02-24 13:52:39
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原创 FASTX-Toolkit 使用說明
警告： 1:在安裝該軟件時候遇到，尤其時運行;make命令時候報錯：“fgets called with bigger size thanlength of destinationbuffer”，請安裝比較新版本，就解決了該問題。其它的基
2020-02-24 13:52:39
原创 Python version 2.7 required, which was not found in the registry
安裝Biopython的時候，不能在註冊表中識別出來python2.7，顯示Python version 2.7 required, which was not found in the registry 在網上找了方法，安裝成功！ 方
2020-02-24 13:52:39
原创 查看linux系統版本是32位的還是64位的
一、 [root@linuxzgf ~]#getconf LONG_BIT [root@linuxzgf ~]#getconf WORD_BIT （32位的系統中int類型和long類型一般都是4字節，64位的系統中int類型還是4字節的
2018-09-01 20:48:25
原创 遠程blast的Perl腳本
問題描述 之前用blast2go太慢，自己寫了個Perl腳本進行遠程blast，可以將fasta文件拆分後並行運行。最後生成XML文件可以直接導入blast2go軟件使用。速度比直接利用blast2go-basic快些。 代碼塊 #!/u
2018-09-01 20:48:23
原创 Centos 6 上安裝R-3.3.1
Centos 6 上安裝R-3.3.1時報錯：checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and headers are require
2018-09-01 20:40:32
原创 bedtools軟件安裝報錯：gzopen函數未定義（undefined reference to `gzopen64'）
在如下網站下載最新版軟件：https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/tag/v2.26.0 https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/downlo
2018-09-01 20:40:32
原创 批量從NCBI後臺下載指定數據的Perl腳本
最近需要在NCBI中下載所有Xanthomonas屬菌株對應的gbk文件，由於NCBI前臺gbk數據已經改版，故打算從後臺ftp.ncbi.nlm.nih.gov下載。寫了個Perl腳本用於批量下載NCBI後臺數據，有這方面需求的同仁們可
2018-09-01 20:40:32
原创 GCdepth散點圖繪製
一 背景 基因組組裝完成後，需要對組裝結果進行評估，其中GC_depth圖是一個比較重要的指標。該圖的橫座標是GC含量，縱座標是平均深度。以30k爲窗口(window)無overlap計算其GC含量和平均深度。如果存在樣品污染，通常能夠從
2018-09-01 20:40:32