原创 改bam文件的樣本id
問題描述：有時經常遇到重測序的數據加測的問題，或者NCBI上下載的數據中一個樣本測了幾個庫，這個時候一個樣本就會有兩對或多對fastq文件。如果你把每個樣本分別比對，使用了不同的ID，那麼合併之後的ID就需要重新修改成樣本名，才能
2020-06-17 10:26:20
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原创 快速從NCBI下載sra數據
推薦兩個軟件ascp和prefetch ASCP 1.下載並安裝： wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.2/aspera-connect-3.
2020-05-30 12:52:17
原创 plink格式的坑
plink格式的坑1 當我使用plink格式文件通過emmax進行全基因組關聯分析後，想看基因型與表型之間的正負關聯關係。於是，我天真的認爲基因型tped文件中的“2 2”就是1/1，“1 1”就是0/0。結果對應到vcf文件中，
2020-03-31 07:42:59
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原创 Aspera從NCBI下載原始數據
1.下載並安裝： wget http://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.7.2/aspera-connect-3.7.2.141527-linux-64.sh sh asper
2018-09-03 14:19:09
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