原创 R語言新神器visdat包（一行代碼看穿整個數據集）
這是一個非常簡單，功能卻非常強大的包 介紹 （1）visdat的目的是 vis_dat通過將數據框中的變量類顯示爲繪圖，並使用vis_miss簡要查看缺失的數據，幫助數據框的可視化。 （2）visdat有6個功能函數： vis_
2019-05-31 14:38:41
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原创 R語言與正則表達式
R語言在提取字符串上有着強大的能力，其中字符串可以看做爲文本信息。今天需要跟大家介紹一款更爲通用、更加底層的文本信息提取工具——正則表達式。 所謂正則表達式，即使用一個字符串來描述、匹配一系列某個語法規則的字符串。通過特定的字母、數字以及特
2019-05-23 14:39:06
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原创 PD-1：K藥、O藥、T藥、B藥、I藥
轉載自（UCOM資訊） PD-1/PD-L1免疫療法是當前備受全世界矚目、正掀起腫瘤治療的革命，引領癌症治療的變革，爲患者帶來新的希望的新一類抗癌免疫療法，旨在充分利用人體自身的免疫系統抵禦、抗擊癌症，通過阻斷PD-1/PD-L1信號通
2019-05-20 14:40:17
原创 R語言之可視化（24）生成帶P值得箱線圖
目錄 R語言之可視化①誤差棒 R語言之可視化②點圖 R語言之可視化③點圖續 R語言之可視化④點韋恩圖upsetR R語言之可視化⑤R圖形系統 R語言之可視化⑥R圖形系統續 R語言之可視化⑦easyGgplot2散點圖 R語言之可視化⑧eas
2019-05-20 14:40:17
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原创 （免費課程轉載）3小時課程帶你重複一篇3分生信SCI(中)
大家好，歡迎再次來到MedGo乾貨課堂，在上期3小時課程帶你重複一篇3分生信SCI(上)中，我們着重爲大家講解了GEO芯片的meta分析。很多同學和老師課後向我們反饋，爲什麼要分上中下？其實上中下的每個部分都代表了一個小專題。以往的生信套路
2019-05-13 14:35:43
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原创 單基因生信分析流程（3）一文解決生存分析和臨牀參數相關分析
單基因生信分析流程（1）一文解決TCGA數據下載整理問題 單基因生信分析流程（2）一文解決差異分析和基因相關分析問題 單基因生信分析流程（3）一文解決生存分析和臨牀參數相關分析 本文目的 （1）繪製生存分析圖 （2）臨牀參數相關分析
2019-05-11 14:36:49
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原创 TCGA數據庫介紹以及下載方式小結
美國政府發起的癌症和腫瘤基因圖譜（Cancer Genome Atlas，TCGA）計劃，試圖通過應用基因組分析技術，特別是採用大規模的基因組測序，將人類全部癌症（近期目標爲50種包括亞型在內的腫瘤）的基因組變異圖譜繪製出來，並進行系統分析
2019-05-05 14:30:29
原创 單基因生信分析流程（1）一文解決TCGA數據下載整理問題
原因 在平常科研工作中，經常有師兄師姐師弟師妹問我：我現在有一個單基因，我該怎麼開展生信研究？出現這個問題的原因是：（1）目前生信研究火熱也逐漸受到認可（2）許多醫學生在開展實驗研究的同時，如果結合生信，則自己的結論和工作量更加吸引到編輯和
2019-05-04 14:29:17
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原创 （免費課程轉載）3小時課程帶你重複一篇3分生信SCI(上)
大家好，歡迎再次來到MedGo乾貨課堂，本次筆者給大家帶來重磅乾貨分享，直接重複一篇3分SCI，從頭至尾，跟我們的視頻進行學習，相信你也一定能夠掌握生信的這類套路，按照我們贈送的代碼直接換一個疾病進行分析，一篇3分的SCI信手拈來。重點是：
2019-05-03 14:28:37
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原创 R語言meta分析(3)亞組分析
R語言meta分析⑴meta包 R語言meta分析(2)單個率的Meta分析 R語言meta分析(3)亞組分析 原始研究中常常採用亞組分析的形式探索入組患者潛在的差異。事實上，亞組分析也廣泛應用於meta分析中，是meta分析中處理異質性的
2019-05-03 14:28:37
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原创 一篇多芯片生信分析（meta）
摘要 背景： 以往的研究表明，miR-144-3p可能是非小細胞肺癌（NSCLC）的潛在生物標誌物。然而，miR-144-3p對NSCLC起源，分化和凋亡的影響以及miR-144-3p與臨牀參數之間關係的綜合機制很少有報道。 方法： 我們通
2019-04-23 15:42:08
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原创 R語言與生信系列①(R入門與臨牀三線表繪製)
我們一直努力爲大家分享科研乾貨。從今天起，MedGo乾貨課堂上線啦 首次分享課講的是TCGA數據分析，探究某一因素與腫瘤臨牀數據之間的關係，並自動生成可以用於SCI發表的三線表，如下圖所示： MedGo乾貨課題課程鏈接：https://
2019-04-18 15:59:21
原创 R的特點以及爲什麼使用R
R的歷史 R語言是統計領域廣泛使用的誕生於1980年左右的[S語言]的一個分支。可以認爲R是S語言的一種實現。而S語言是由AT&T貝爾實驗室開發的一種用來進行數據探索、統計分析和作圖的[解釋型語言]。最初S語言的實現版本主要是S-PLUS。
2019-04-10 14:58:00
原创 RStudio下載安裝
RStudio是一種R語言的集成開發環境(IDE)，其亮點是出色的界面設計及編程輔助工具。它可以在多種平臺上運行，包括windows，Mac，Ubuntu，以及網頁版。另外這個軟件是免費和開源的!可以在官方網頁： 官網下載RStudio安
2019-04-10 14:58:00
原创 R語言安裝
1找到並打開打開R語言官網 2點擊主頁面上的download R 3在跳轉的鏡像界面，下拉選擇中國的鏡像，這裏選擇第一個清華大學地址。 4根據自己的操作系統選擇相應的版本，選擇 Download R for Win
2019-04-10 14:58:00
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